More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2187 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  60.35 
 
 		 538 aa  650    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  84.94 
 
 		 540 aa  913    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  77.69 
 
 		 539 aa  862    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  59.69 
 
 		 538 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  59.15 
 
 		 540 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 519 aa  1064    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  58.61 
 
 		 526 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6444  twin-arginine translocation pathway signal  60.66 
 
 		 527 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6277  extracellular solute-binding protein  60.66 
 
 		 527 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0281814  normal  0.114415 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6679  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component  60.66 
 
 		 527 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6057  extracellular solute-binding protein  59.83 
 
 		 527 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6354  extracellular solute-binding protein  59.83 
 
 		 527 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  52.75 
 
 		 545 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  52.56 
 
 		 545 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  51.16 
 
 		 536 aa  546  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  53.75 
 
 		 527 aa  547  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  51.54 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  50.77 
 
 		 537 aa  531  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  49.52 
 
 		 537 aa  527  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  49.52 
 
 		 536 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  49.52 
 
 		 536 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  49.33 
 
 		 535 aa  511  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  47.41 
 
 		 537 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  47.76 
 
 		 513 aa  503  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  49.48 
 
 		 509 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  39.48 
 
 		 525 aa  361  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  38.97 
 
 		 520 aa  359  9e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  38.25 
 
 		 513 aa  355  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  38.65 
 
 		 529 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  38.65 
 
 		 529 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  38.68 
 
 		 529 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  35.88 
 
 		 519 aa  325  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  35.6 
 
 		 529 aa  318  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  34.67 
 
 		 526 aa  300  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  35.82 
 
 		 518 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  36.29 
 
 		 535 aa  289  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  36.1 
 
 		 535 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  36.1 
 
 		 535 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  38.68 
 
 		 527 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  34.47 
 
 		 522 aa  281  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  34.97 
 
 		 534 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  34.97 
 
 		 534 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  33.61 
 
 		 534 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  33.01 
 
 		 512 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  33.19 
 
 		 496 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  32.84 
 
 		 511 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.48 
 
 		 516 aa  229  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  31.31 
 
 		 538 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  31.6 
 
 		 516 aa  217  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  29.71 
 
 		 532 aa  213  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 515 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 		 513 aa  190  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0576  extracellular solute-binding protein family 5  29.57 
 
 		 533 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  28.88 
 
 		 538 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 517 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 517 aa  170  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 517 aa  167  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 524 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.8 
 
 		 502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 		 523 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  28.89 
 
 		 554 aa  159  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.48 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3756  putative peptide ABC transporter, substrate- binding protein  27.49 
 
 		 514 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279615  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.39 
 
 		 513 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 561 aa  153  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 		 503 aa  146  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.4 
 
 		 531 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0112  extracellular solute-binding protein family 5  27.6 
 
 		 524 aa  145  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214652  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.54 
 
 		 505 aa  144  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3973  extracellular solute-binding protein family 5  28.48 
 
 		 505 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617507  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5692  extracellular solute-binding protein family 5  25.55 
 
 		 555 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 550 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5711  extracellular solute-binding protein family 5  28.82 
 
 		 550 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3559  extracellular solute-binding protein  28.73 
 
 		 526 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.97 
 
 		 510 aa  137  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  25.35 
 
 		 527 aa  137  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 510 aa  136  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  26.42 
 
 		 514 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 		 522 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4848  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.26 
 
 		 539 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 495 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2918  extracellular solute-binding protein family 5  28.11 
 
 		 538 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258086  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 544 aa  134  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 529 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.17 
 
 		 559 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.39 
 
 		 521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 531 aa  131  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1152  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 538 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  26.7 
 
 		 495 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2156  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 543 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.470572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.29 
 
 		 535 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1041  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 538 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  28.3 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1360  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 543 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0151381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 511 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5706  extracellular solute-binding protein family 5  27.54 
 
 		 552 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 549 aa  127  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  32 
 
 		 516 aa  127  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>