More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3559 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3559  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 526 aa  1039    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  36.94 
 
 		 513 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 		 517 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  33.01 
 
 		 524 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.43 
 
 		 516 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 		 517 aa  206  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 		 529 aa  199  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 		 517 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  28.77 
 
 		 518 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  29.77 
 
 		 513 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 		 525 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0576  extracellular solute-binding protein family 5  29.42 
 
 		 533 aa  190  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  31.21 
 
 		 503 aa  187  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 520 aa  187  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  30.69 
 
 		 529 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3973  extracellular solute-binding protein family 5  35.51 
 
 		 505 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617507  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 		 529 aa  181  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  30.04 
 
 		 529 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.49 
 
 		 538 aa  176  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 		 540 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  30.93 
 
 		 526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6277  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 527 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0281814  normal  0.114415 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6444  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 		 527 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6679  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component  30.77 
 
 		 527 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  29.55 
 
 		 538 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 		 519 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  30.3 
 
 		 512 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  32.19 
 
 		 496 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.48 
 
 		 526 aa  171  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  28.16 
 
 		 535 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6057  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 527 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6354  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 		 527 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  29.07 
 
 		 513 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  29.46 
 
 		 545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.99 
 
 		 537 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 		 509 aa  164  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 537 aa  161  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 527 aa  160  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.69 
 
 		 545 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 535 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.21 
 
 		 535 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 		 539 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.56 
 
 		 505 aa  157  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  27.84 
 
 		 537 aa  156  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2510  extracellular solute-binding protein  32.7 
 
 		 519 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  33.17 
 
 		 527 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 510 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  29.5 
 
 		 532 aa  154  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 535 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  31.65 
 
 		 511 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 534 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 535 aa  152  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  26.6 
 
 		 536 aa  150  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 536 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3756  putative peptide ABC transporter, substrate- binding protein  30.3 
 
 		 514 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279615  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  30.79 
 
 		 502 aa  147  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.96 
 
 		 534 aa  146  9e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  28.85 
 
 		 522 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 515 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 534 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  26.6 
 
 		 536 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.25 
 
 		 512 aa  139  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 519 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 		 511 aa  137  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  27.16 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5088  putative oligopeptide/dipeptide ABC transporter  30.71 
 
 		 527 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0437131  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  29 
 
 		 540 aa  134  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  29.31 
 
 		 516 aa  133  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0370  extracellular solute-binding protein  29.98 
 
 		 497 aa  133  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.735975  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1556  extracellular solute-binding protein family 5  30.03 
 
 		 525 aa  133  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1189  4-phytase  26.4 
 
 		 523 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5692  extracellular solute-binding protein family 5  26.86 
 
 		 555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  27.96 
 
 		 527 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.61 
 
 		 540 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.89 
 
 		 510 aa  127  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 		 555 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 		 516 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 523 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.33 
 
 		 546 aa  124  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 500 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  28.89 
 
 		 559 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0112  extracellular solute-binding protein family 5  29.33 
 
 		 524 aa  124  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214652  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.1 
 
 		 520 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 561 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  29.45 
 
 		 506 aa  123  9e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 550 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2062  twin-arginine translocation pathway signal  26.24 
 
 		 550 aa  123  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.511061  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.43 
 
 		 525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1867  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 527 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546614  normal  0.0646948 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0188  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 547 aa  121  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  29.03 
 
 		 525 aa  120  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 595 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  26.76 
 
 		 554 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 512 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 512 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 512 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  27.4 
 
 		 502 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  28.45 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0112  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>