More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1867 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1556  extracellular solute-binding protein family 5  69.76 
 
 		 525 aa  762    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5088  putative oligopeptide/dipeptide ABC transporter  66.86 
 
 		 527 aa  748    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0437131  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1867  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 527 aa  1082    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546614  normal  0.0646948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2210  extracellular solute-binding protein  43.34 
 
 		 530 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.046819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0400  extracellular solute-binding protein family 5  42.45 
 
 		 525 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1411  extracellular solute-binding protein family 5  39.92 
 
 		 537 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5251  putative ABC transporter substrate-binding protein  39.84 
 
 		 517 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1835  extracellular solute-binding protein family 5  40.91 
 
 		 544 aa  375  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0979  extracellular solute-binding protein  38.42 
 
 		 530 aa  368  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297745  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1226  extracellular solute-binding protein  39.6 
 
 		 536 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5254  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  38.78 
 
 		 537 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.534405  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4022  extracellular solute-binding protein  39.53 
 
 		 536 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00714098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4745  extracellular solute-binding protein  41.6 
 
 		 533 aa  363  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1971  extracellular solute-binding protein  40.2 
 
 		 529 aa  361  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1200  extracellular solute-binding protein  39.12 
 
 		 535 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5253  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  37.64 
 
 		 537 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0401744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3927  extracellular solute-binding protein  40.16 
 
 		 533 aa  352  8e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180708  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5818  extracellular solute-binding protein  40.08 
 
 		 531 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0665054  normal  0.029553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3055  extracellular solute-binding protein  38.74 
 
 		 530 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.169958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5122  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  37.72 
 
 		 534 aa  333  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4366  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 528 aa  331  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4251  extracellular solute-binding protein  39.64 
 
 		 523 aa  330  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497786  normal  0.0434638 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5806  extracellular solute-binding protein  37.68 
 
 		 530 aa  329  7e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.068843  normal  0.564208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3643  twin-arginine translocation pathway signal  36.52 
 
 		 533 aa  325  9e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.166369  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3922  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 		 526 aa  318  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2002  extracellular solute-binding protein  35.38 
 
 		 527 aa  314  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3800  extracellular solute-binding protein  36.33 
 
 		 530 aa  308  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129084 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1499  extracellular solute-binding protein  34.13 
 
 		 524 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.779721  normal  0.296474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4438  extracellular solute-binding protein  38.97 
 
 		 523 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0985  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 		 511 aa  183  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0656  twin-arginine translocation pathway signal  28.95 
 
 		 521 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.435676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0934  twin-arginine translocation pathway signal  27.32 
 
 		 537 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1214  extracellular solute-binding protein family 5  27.84 
 
 		 524 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2984  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 508 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3323  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 527 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5086  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  28.42 
 
 		 517 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243076  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3892  ABC di/oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.82 
 
 		 518 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206545  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4147  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 518 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1090  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.41 
 
 		 514 aa  160  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6670  extracellular solute-binding protein family 5  25.63 
 
 		 508 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000010094  normal  0.0327722 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5763  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 		 508 aa  151  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  unclonable  0.000000000235373  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.7 
 
 		 505 aa  137  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 515 aa  137  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  29.21 
 
 		 545 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4211  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 504 aa  134  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 520 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 520 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 520 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  27.39 
 
 		 513 aa  130  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  27.39 
 
 		 513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  32.37 
 
 		 560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2173  extracellular solute-binding protein family 5  27.85 
 
 		 544 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  27.14 
 
 		 516 aa  128  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 		 516 aa  128  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 520 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 520 aa  127  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.42 
 
 		 510 aa  126  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.14 
 
 		 512 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.68 
 
 		 520 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  26.68 
 
 		 520 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.68 
 
 		 520 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.94 
 
 		 512 aa  126  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 		 520 aa  126  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.68 
 
 		 520 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.94 
 
 		 512 aa  126  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2436  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 514 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.68 
 
 		 520 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.68 
 
 		 520 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  26.68 
 
 		 520 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  27.17 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  26.96 
 
 		 512 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.73 
 
 		 512 aa  124  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  27.16 
 
 		 514 aa  124  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  26.73 
 
 		 493 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  26.73 
 
 		 512 aa  124  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  26.73 
 
 		 512 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 512 aa  124  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  29.63 
 
 		 535 aa  124  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  26.76 
 
 		 520 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.93 
 
 		 520 aa  124  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  26.21 
 
 		 517 aa  124  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  26.96 
 
 		 512 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.73 
 
 		 512 aa  123  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  26.96 
 
 		 512 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  26.96 
 
 		 512 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 550 aa  123  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  26.77 
 
 		 512 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  25.6 
 
 		 504 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3559  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 526 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 		 521 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 510 aa  121  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 535 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  26.63 
 
 		 518 aa  120  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 512 aa  120  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6643  extracellular solute-binding protein family 5  24.61 
 
 		 514 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5947  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 		 521 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.281116  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1920  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 607 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689476  normal  0.0152046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 534 aa  119  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>