More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0188 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3387  extracellular solute-binding protein family 5  87.87 
 
 		 550 aa  985    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0188  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 547 aa  1109    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1271  ABC transporter, periplasmic binding protein  56.69 
 
 		 528 aa  621  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000259921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2471  putative ABC transporter periplasmic binding protein  56.77 
 
 		 530 aa  598  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10018 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08370  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  48.59 
 
 		 547 aa  435  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06680  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  39.89 
 
 		 525 aa  377  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000372543  normal  0.255135 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2145  extracellular solute-binding protein family 5  41.47 
 
 		 537 aa  362  9e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0935  extracellular solute-binding protein family 5  37.66 
 
 		 533 aa  308  1.0000000000000001e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 505 aa  157  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.89 
 
 		 534 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  27.66 
 
 		 565 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.02 
 
 		 535 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.92 
 
 		 510 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  28.66 
 
 		 516 aa  137  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  29.57 
 
 		 562 aa  134  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.08 
 
 		 512 aa  134  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 515 aa  134  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  28.08 
 
 		 512 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  28.08 
 
 		 512 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0360  extracellular solute-binding protein family 5  27.13 
 
 		 506 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.08 
 
 		 512 aa  133  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.08 
 
 		 512 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.08 
 
 		 512 aa  133  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  27.26 
 
 		 525 aa  133  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.85 
 
 		 493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  27.43 
 
 		 512 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  27.68 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  30.64 
 
 		 527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0504  ABC transporter substrate-binding protein  29.3 
 
 		 531 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.325614  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  27.47 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  27.68 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  27.68 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.88 
 
 		 512 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 495 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  28.61 
 
 		 509 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3787  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 531 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.216169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 512 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  28.78 
 
 		 528 aa  130  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.51 
 
 		 520 aa  130  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 520 aa  130  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  28.12 
 
 		 514 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.53 
 
 		 521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  29.81 
 
 		 526 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.52 
 
 		 532 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 526 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 527 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 532 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 526 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  28.76 
 
 		 547 aa  128  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.53 
 
 		 521 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.53 
 
 		 521 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 521 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  28.06 
 
 		 543 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.53 
 
 		 521 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  27.61 
 
 		 514 aa  127  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 510 aa  126  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.77 
 
 		 520 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 528 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  29.27 
 
 		 514 aa  126  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0112  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 506 aa  126  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876976  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.27 
 
 		 521 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  26.31 
 
 		 542 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.12 
 
 		 525 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  29.22 
 
 		 519 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  31.77 
 
 		 514 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 547 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 520 aa  125  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1103  extracellular solute-binding protein family 5  28.28 
 
 		 524 aa  124  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  29.11 
 
 		 532 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  29.11 
 
 		 532 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 538 aa  124  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  28.35 
 
 		 535 aa  124  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 		 531 aa  124  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 		 513 aa  124  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  28.31 
 
 		 543 aa  123  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.99 
 
 		 547 aa  123  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  28.08 
 
 		 531 aa  123  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 532 aa  123  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  33.02 
 
 		 492 aa  123  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.86 
 
 		 546 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  32.58 
 
 		 509 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.6 
 
 		 542 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 512 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.61 
 
 		 502 aa  123  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 		 499 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  25.98 
 
 		 515 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 520 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  28.36 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.36 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4557  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.91 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.36 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 528 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  28.19 
 
 		 520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 534 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>