More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0750 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  100 
 
 		 559 aa  1121    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3169  extracellular solute-binding protein family 5  45.03 
 
 		 529 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3349  extracellular solute-binding protein family 5  37.81 
 
 		 559 aa  359  9e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109598  normal  0.0359992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5265  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  33.06 
 
 		 515 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154423  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2114  extracellular solute-binding protein family 5  30.95 
 
 		 538 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.59472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.31 
 
 		 510 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4848  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.11 
 
 		 539 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 510 aa  173  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6175  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  29.32 
 
 		 541 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  30.62 
 
 		 519 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5711  extracellular solute-binding protein family 5  27.9 
 
 		 550 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 512 aa  170  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 512 aa  170  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 512 aa  170  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.43 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.43 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.94 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.43 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5706  extracellular solute-binding protein family 5  28.25 
 
 		 552 aa  168  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5044  extracellular solute-binding protein family 5  28.97 
 
 		 566 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  29.81 
 
 		 514 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 511 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 		 502 aa  160  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 515 aa  160  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.68 
 
 		 531 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 528 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  28.69 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.81 
 
 		 505 aa  155  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 510 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 		 509 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 493 aa  153  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  28.63 
 
 		 516 aa  153  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.86 
 
 		 504 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.21 
 
 		 505 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  28.36 
 
 		 523 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.71 
 
 		 545 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  28.15 
 
 		 541 aa  151  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.93 
 
 		 521 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 521 aa  150  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 535 aa  150  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0973  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 532 aa  148  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 530 aa  148  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 535 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 547 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  26.95 
 
 		 537 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.39 
 
 		 532 aa  147  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  26.28 
 
 		 509 aa  146  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  28.42 
 
 		 516 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 534 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  26.97 
 
 		 589 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0360  extracellular solute-binding protein family 5  25.87 
 
 		 506 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 		 489 aa  144  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  26.31 
 
 		 534 aa  143  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 527 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  26.37 
 
 		 516 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 542 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 526 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 529 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  25.78 
 
 		 525 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 541 aa  140  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  26.96 
 
 		 524 aa  140  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  25.96 
 
 		 520 aa  140  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 512 aa  140  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.66 
 
 		 512 aa  140  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 		 533 aa  140  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  26.23 
 
 		 509 aa  140  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 523 aa  140  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.87 
 
 		 512 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  28 
 
 		 532 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 522 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  27.61 
 
 		 528 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.4 
 
 		 534 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.66 
 
 		 512 aa  139  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  31.03 
 
 		 523 aa  138  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  26.46 
 
 		 595 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.66 
 
 		 512 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.91 
 
 		 520 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.66 
 
 		 512 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  27.7 
 
 		 533 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 		 512 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3775  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.28 
 
 		 556 aa  138  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0112  extracellular solute-binding protein family 5  27.75 
 
 		 524 aa  138  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214652  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  27.66 
 
 		 512 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 517 aa  138  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.53 
 
 		 535 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29 
 
 		 492 aa  137  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8313  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.14 
 
 		 516 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291124  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29 
 
 		 479 aa  137  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  29.51 
 
 		 528 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 		 514 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  26.56 
 
 		 515 aa  136  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.54 
 
 		 493 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 		 539 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 551 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.31 
 
 		 520 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  26.19 
 
 		 526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3804  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726853  hitchhiker  0.0000406829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>