More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3787 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3787  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
531 aa  1090    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.216169  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0504  ABC transporter substrate-binding protein  97.74 
 
 
531 aa  1045    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.325614  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5167  4-phytase  63.56 
 
 
530 aa  689    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal  0.719428 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  30.55 
 
 
544 aa  209  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  30.3 
 
 
544 aa  206  7e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  33.33 
 
 
540 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  32.35 
 
 
538 aa  204  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
540 aa  203  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  30.58 
 
 
534 aa  202  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  33.13 
 
 
540 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 
538 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.64 
 
 
535 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 
538 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  29.12 
 
 
520 aa  181  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  28.29 
 
 
531 aa  179  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  32.97 
 
 
539 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.55 
 
 
538 aa  176  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 
505 aa  176  9e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.15 
 
 
517 aa  172  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  30.35 
 
 
517 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.67 
 
 
512 aa  171  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  27.29 
 
 
546 aa  170  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 
520 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 
505 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  29.63 
 
 
503 aa  169  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  29.94 
 
 
521 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  30.37 
 
 
520 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  29.42 
 
 
512 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  28.32 
 
 
520 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.29 
 
 
512 aa  167  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.29 
 
 
512 aa  167  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.29 
 
 
512 aa  167  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
524 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.13 
 
 
520 aa  166  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.09 
 
 
512 aa  166  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2170  extracellular solute-binding protein family 5  28.86 
 
 
535 aa  166  9e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 
520 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  27.5 
 
 
502 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  29.57 
 
 
512 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 
522 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  29.57 
 
 
512 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  29.36 
 
 
512 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  29.36 
 
 
512 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  29.36 
 
 
512 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  28.85 
 
 
512 aa  163  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  28.85 
 
 
512 aa  163  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 
520 aa  163  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 
520 aa  163  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 
520 aa  163  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0955  4-phytase  28.85 
 
 
534 aa  162  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00228685  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 
540 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
521 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  29.78 
 
 
520 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  29.3 
 
 
493 aa  161  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  28.02 
 
 
532 aa  161  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5692  extracellular solute-binding protein family 5  29.3 
 
 
555 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 
539 aa  161  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 
520 aa  160  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  30.49 
 
 
517 aa  160  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.23 
 
 
520 aa  159  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 
517 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.74 
 
 
537 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 
528 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  29.5 
 
 
520 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0960  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 
547 aa  159  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  29.5 
 
 
520 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.5 
 
 
520 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  29.5 
 
 
520 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  29.5 
 
 
520 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 
519 aa  159  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 
520 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  29.5 
 
 
520 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  29.5 
 
 
520 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  29.12 
 
 
514 aa  158  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  28.19 
 
 
545 aa  157  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  28.76 
 
 
515 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 
512 aa  157  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
518 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  27.64 
 
 
529 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 
529 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 
507 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
509 aa  154  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  27.41 
 
 
594 aa  154  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4561  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.18 
 
 
531 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 
532 aa  154  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  29.45 
 
 
514 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 
520 aa  153  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 
533 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3535  extracellular solute-binding protein family 5  26.98 
 
 
544 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269906  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 
512 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4041  extracellular solute-binding protein family 5  25.61 
 
 
543 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457031  normal  0.172562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
516 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  27.97 
 
 
531 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1408  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 
518 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00741999  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 
531 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  27.97 
 
 
531 aa  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 
535 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  28.06 
 
 
535 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  28.06 
 
 
535 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
559 aa  150  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>