More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1440 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  72.98 
 
 		 516 aa  787    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 514 aa  1051    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  72.58 
 
 		 516 aa  786    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  82.23 
 
 		 512 aa  888    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  45.31 
 
 		 533 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  45.86 
 
 		 530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  45.12 
 
 		 533 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  42.8 
 
 		 509 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  42.83 
 
 		 528 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  41.6 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  42.35 
 
 		 535 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  42.51 
 
 		 532 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  42.51 
 
 		 532 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  42.47 
 
 		 537 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  41.52 
 
 		 531 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  39.88 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  40.73 
 
 		 528 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  41.07 
 
 		 538 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  41.34 
 
 		 522 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  40.61 
 
 		 526 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  39.04 
 
 		 525 aa  347  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  39.38 
 
 		 521 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  38.59 
 
 		 521 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  37.97 
 
 		 549 aa  330  5.0000000000000004e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  35.86 
 
 		 544 aa  323  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  36.4 
 
 		 515 aa  317  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  37.05 
 
 		 534 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  37.25 
 
 		 534 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  33.4 
 
 		 542 aa  272  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  33.54 
 
 		 531 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  32.7 
 
 		 528 aa  265  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  32.5 
 
 		 528 aa  263  8e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  32.03 
 
 		 526 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  34.14 
 
 		 530 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 		 528 aa  259  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 527 aa  253  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  32.94 
 
 		 520 aa  252  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  31.45 
 
 		 532 aa  250  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  33.27 
 
 		 517 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  31.3 
 
 		 528 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  34.12 
 
 		 544 aa  249  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  32.87 
 
 		 519 aa  247  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  31.92 
 
 		 538 aa  248  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 		 517 aa  245  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  32.01 
 
 		 516 aa  243  5e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  32.09 
 
 		 518 aa  243  5e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  31.78 
 
 		 526 aa  243  7e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  31.57 
 
 		 526 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  31.69 
 
 		 514 aa  240  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  31.64 
 
 		 526 aa  240  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 		 523 aa  239  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  31.35 
 
 		 523 aa  239  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 556 aa  237  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  33.47 
 
 		 497 aa  236  8e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  31.14 
 
 		 527 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  31.07 
 
 		 526 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 520 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1815  extracellular solute-binding protein  31.85 
 
 		 532 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  32.17 
 
 		 460 aa  233  7.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  31.71 
 
 		 528 aa  232  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  30.16 
 
 		 595 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.96 
 
 		 528 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  30.72 
 
 		 529 aa  225  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 		 514 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 		 520 aa  224  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  30.96 
 
 		 535 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 		 505 aa  221  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 531 aa  221  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 526 aa  219  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  30.32 
 
 		 534 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0423  extracellular solute-binding protein  31.99 
 
 		 527 aa  213  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204725  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 		 517 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0422  extracellular solute-binding protein  32.35 
 
 		 527 aa  212  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147362  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 		 520 aa  210  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 524 aa  207  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  31.59 
 
 		 526 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  29.08 
 
 		 499 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.82 
 
 		 521 aa  196  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 521 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.2 
 
 		 521 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.2 
 
 		 521 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.2 
 
 		 521 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  30.89 
 
 		 505 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  31.34 
 
 		 514 aa  191  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 528 aa  189  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 		 522 aa  188  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  28.22 
 
 		 524 aa  187  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  28.34 
 
 		 527 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  30.27 
 
 		 514 aa  186  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  28.77 
 
 		 541 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 		 532 aa  184  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.66 
 
 		 510 aa  181  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  30.77 
 
 		 495 aa  179  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 		 519 aa  179  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 512 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.75 
 
 		 512 aa  176  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.75 
 
 		 512 aa  176  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.75 
 
 		 512 aa  176  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  29.47 
 
 		 512 aa  176  9e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  29.47 
 
 		 512 aa  176  9e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>