More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3737 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3737  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 517 aa  1059    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  36.02 
 
 		 499 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 		 505 aa  204  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 528 aa  203  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 535 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  30.39 
 
 		 528 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 535 aa  178  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  30.02 
 
 		 526 aa  177  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  25.81 
 
 		 509 aa  177  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 527 aa  177  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  28.49 
 
 		 531 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 		 526 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  27.79 
 
 		 533 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 528 aa  170  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 492 aa  169  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.58 
 
 		 530 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 		 528 aa  169  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0184  extracellular solute-binding protein family 5  25.4 
 
 		 518 aa  167  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  29.03 
 
 		 502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  32.85 
 
 		 493 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  29.21 
 
 		 534 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.92 
 
 		 492 aa  161  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.41 
 
 		 521 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.41 
 
 		 521 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 521 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.41 
 
 		 521 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 530 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 521 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.86 
 
 		 479 aa  161  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4134  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 516 aa  160  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  27.41 
 
 		 533 aa  160  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  25.96 
 
 		 528 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.66 
 
 		 521 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.18 
 
 		 521 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 526 aa  159  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 524 aa  159  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  30.89 
 
 		 535 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  27.97 
 
 		 526 aa  159  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 495 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 528 aa  158  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 526 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  26.65 
 
 		 532 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  28.49 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 510 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  26.04 
 
 		 532 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 		 524 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  26.18 
 
 		 528 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 538 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  26.04 
 
 		 532 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 595 aa  154  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 528 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5265  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  30.79 
 
 		 515 aa  153  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154423  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.87 
 
 		 542 aa  153  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.85 
 
 		 528 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  26.91 
 
 		 537 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  27.58 
 
 		 526 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 516 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 507 aa  151  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 531 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 514 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  29.5 
 
 		 516 aa  150  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 		 534 aa  150  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 		 522 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0422  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147362  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.27 
 
 		 520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 534 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  27.69 
 
 		 527 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  25.87 
 
 		 516 aa  147  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 		 520 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 520 aa  147  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 520 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 		 528 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 544 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  28.65 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 529 aa  144  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 520 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 492 aa  144  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.86 
 
 		 504 aa  144  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 514 aa  143  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  28.25 
 
 		 516 aa  143  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2474  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 525 aa  143  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  26.79 
 
 		 525 aa  143  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 509 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 517 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.59 
 
 		 532 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 520 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 520 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.19 
 
 		 524 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 549 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0028  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 		 520 aa  140  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183012 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.94 
 
 		 520 aa  140  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 512 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  25.3 
 
 		 520 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 512 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 512 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 		 505 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3804  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 501 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726853  hitchhiker  0.0000406829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.33 
 
 		 510 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>