More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5265 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5265  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  100 
 
 		 515 aa  1043    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154423  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3349  extracellular solute-binding protein family 5  36.44 
 
 		 559 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109598  normal  0.0359992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  32.87 
 
 		 559 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2114  extracellular solute-binding protein family 5  32.11 
 
 		 538 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.59472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3169  extracellular solute-binding protein family 5  31.58 
 
 		 529 aa  192  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.04 
 
 		 505 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4848  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.44 
 
 		 539 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5706  extracellular solute-binding protein family 5  30.51 
 
 		 552 aa  170  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.06 
 
 		 534 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5711  extracellular solute-binding protein family 5  27.8 
 
 		 550 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.76 
 
 		 528 aa  163  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 		 510 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 		 535 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.38 
 
 		 535 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 511 aa  158  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.22 
 
 		 521 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.48 
 
 		 510 aa  156  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 521 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 528 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 549 aa  155  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 528 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 528 aa  153  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3737  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 		 517 aa  153  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  29.68 
 
 		 528 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 526 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  29.09 
 
 		 525 aa  152  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 505 aa  151  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2236  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 547 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0669965  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6175  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  28.4 
 
 		 541 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 493 aa  150  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  28.07 
 
 		 526 aa  150  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.41 
 
 		 505 aa  150  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 544 aa  149  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 		 528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.39 
 
 		 544 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  30.73 
 
 		 541 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.5 
 
 		 540 aa  148  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0973  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 532 aa  148  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 538 aa  148  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 		 531 aa  148  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 528 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  27.78 
 
 		 528 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 525 aa  146  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  27.5 
 
 		 540 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 		 522 aa  146  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 538 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 540 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 		 537 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  25.95 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 526 aa  145  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  29.98 
 
 		 524 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  30 
 
 		 528 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  29.05 
 
 		 529 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  27.73 
 
 		 526 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  30.35 
 
 		 531 aa  144  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3824  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 524 aa  143  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.54 
 
 		 540 aa  143  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 595 aa  143  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  27.79 
 
 		 510 aa  143  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  27.9 
 
 		 509 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  30.43 
 
 		 532 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  27.34 
 
 		 539 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  30.69 
 
 		 532 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.3 
 
 		 540 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 523 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.87 
 
 		 542 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.34 
 
 		 520 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 538 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 515 aa  140  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  28.61 
 
 		 528 aa  140  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  30.52 
 
 		 460 aa  139  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  29.81 
 
 		 497 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  27.71 
 
 		 514 aa  139  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  28.07 
 
 		 565 aa  139  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5044  extracellular solute-binding protein family 5  32.19 
 
 		 566 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  29.74 
 
 		 526 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  24.85 
 
 		 590 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 		 513 aa  137  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  28.07 
 
 		 516 aa  136  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  25.94 
 
 		 520 aa  136  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 544 aa  136  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 510 aa  136  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  25.67 
 
 		 516 aa  136  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  26.18 
 
 		 513 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 534 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.55 
 
 		 532 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 544 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 501 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 		 513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 520 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>