More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2114 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2114  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
538 aa  1090    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.59472  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3349  extracellular solute-binding protein family 5  31.09 
 
 
559 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109598  normal  0.0359992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  31.18 
 
 
559 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5265  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  31.68 
 
 
515 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154423  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3169  extracellular solute-binding protein family 5  32.8 
 
 
529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2236  extracellular solute-binding protein family 5  28.63 
 
 
547 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0669965  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
512 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
512 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
512 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 
532 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.1 
 
 
510 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 
517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
510 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 
492 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5711  extracellular solute-binding protein family 5  28 
 
 
550 aa  128  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.61 
 
 
540 aa  127  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  26.61 
 
 
508 aa  126  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5706  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 
552 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  26.41 
 
 
527 aa  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 
509 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  27.52 
 
 
537 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 
510 aa  123  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4848  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.89 
 
 
539 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 
492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.77 
 
 
492 aa  120  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 
510 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0232  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 
517 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.08 
 
 
479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 
489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 
515 aa  117  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 
528 aa  117  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  25.24 
 
 
565 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  27.59 
 
 
519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.22 
 
 
505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 
493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4734  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 
521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676308  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0409  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.95 
 
 
527 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
535 aa  115  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0352  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.95 
 
 
527 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.78 
 
 
508 aa  114  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  24.93 
 
 
513 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  26.49 
 
 
502 aa  113  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  25.54 
 
 
518 aa  113  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 
531 aa  113  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 
501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  24.34 
 
 
513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  22.57 
 
 
518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 
521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 
516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  22.71 
 
 
521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.71 
 
 
521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  24.57 
 
 
514 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  22.71 
 
 
521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 
519 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.95 
 
 
539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  25.61 
 
 
525 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.56 
 
 
528 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 
541 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  23.63 
 
 
534 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 
528 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0365  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.32 
 
 
521 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3112  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 
505 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.817588  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  24.53 
 
 
502 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  26.3 
 
 
497 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  25.22 
 
 
535 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  24.25 
 
 
526 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 
535 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 
595 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
534 aa  110  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  26.27 
 
 
509 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.55 
 
 
524 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  29.45 
 
 
495 aa  110  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0462348 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  24.75 
 
 
512 aa  110  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  22.48 
 
 
521 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  24.75 
 
 
512 aa  110  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  22.97 
 
 
505 aa  110  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.75 
 
 
512 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5044  extracellular solute-binding protein family 5  33.07 
 
 
566 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  24.84 
 
 
516 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5088  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 
553 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.416607 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.75 
 
 
512 aa  109  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  26.51 
 
 
493 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.04 
 
 
520 aa  109  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.75 
 
 
512 aa  109  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 
522 aa  109  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
523 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.75 
 
 
512 aa  109  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 
512 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.75 
 
 
512 aa  109  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  27.4 
 
 
496 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.1 
 
 
531 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
511 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0130  extracellular solute-binding protein family 5  28.26 
 
 
542 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 
517 aa  108  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  24.78 
 
 
499 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  27.11 
 
 
512 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 
534 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 
535 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  26.81 
 
 
512 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  26.81 
 
 
512 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>