More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4734 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4734  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 521 aa  1085    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  61.52 
 
 		 514 aa  650    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  61.32 
 
 		 510 aa  641    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  60.24 
 
 		 506 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2267  extracellular solute-binding protein  60.24 
 
 		 506 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3824  extracellular solute-binding protein  56.32 
 
 		 524 aa  615  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  59.34 
 
 		 510 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  57.92 
 
 		 530 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  57.71 
 
 		 513 aa  596  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  46.63 
 
 		 507 aa  477  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3112  extracellular solute-binding protein  35.6 
 
 		 505 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  33.19 
 
 		 497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 505 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.76 
 
 		 525 aa  161  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  29.24 
 
 		 527 aa  158  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.54 
 
 		 520 aa  157  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.64 
 
 		 541 aa  151  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.82 
 
 		 521 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.61 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.61 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.61 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.69 
 
 		 530 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 527 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 528 aa  148  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.27 
 
 		 504 aa  148  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 531 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  29.42 
 
 		 531 aa  147  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  31.42 
 
 		 529 aa  146  7.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  28.27 
 
 		 531 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  26.92 
 
 		 517 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.31 
 
 		 528 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  27.11 
 
 		 519 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  28.46 
 
 		 533 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.15 
 
 		 542 aa  144  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  29.93 
 
 		 528 aa  143  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  29.17 
 
 		 502 aa  143  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  28.65 
 
 		 502 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  28.96 
 
 		 524 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  27.7 
 
 		 533 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.95 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 509 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.09 
 
 		 520 aa  141  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 512 aa  141  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 538 aa  140  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 526 aa  140  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.36 
 
 		 534 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  30.09 
 
 		 513 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 510 aa  139  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  29.79 
 
 		 518 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.58 
 
 		 532 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 528 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  26.21 
 
 		 525 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 		 520 aa  137  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 514 aa  137  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 		 522 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 522 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  26.61 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 512 aa  136  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 509 aa  136  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  27.33 
 
 		 531 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  25.9 
 
 		 527 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 530 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  26.11 
 
 		 518 aa  135  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  28.88 
 
 		 526 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  26.97 
 
 		 528 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 526 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  25.37 
 
 		 526 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 528 aa  134  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 517 aa  134  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  29.5 
 
 		 513 aa  134  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  26.6 
 
 		 517 aa  133  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  27.73 
 
 		 528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  29.43 
 
 		 528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  27.95 
 
 		 520 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.65 
 
 		 510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  27.38 
 
 		 532 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5265  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  26.32 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154423  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 526 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 525 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  26.5 
 
 		 527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  29.5 
 
 		 513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1968  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  25.63 
 
 		 516 aa  131  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 		 532 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 509 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  28.45 
 
 		 516 aa  130  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.97 
 
 		 520 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7174  peptide ABC transporter substrate-binding protein  26.05 
 
 		 503 aa  130  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 		 532 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  27.14 
 
 		 565 aa  130  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.79 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  29.79 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  29.79 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1077  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 544 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  29.79 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>