More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7174 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7174  peptide ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 503 aa  1023    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1968  extracellular solute-binding protein  60.82 
 
 		 518 aa  630  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4493  extracellular solute-binding protein  35.07 
 
 		 577 aa  269  8.999999999999999e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  27.06 
 
 		 532 aa  153  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  27.06 
 
 		 533 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3824  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 524 aa  148  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 535 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 		 533 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 509 aa  147  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  25.96 
 
 		 535 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  25.96 
 
 		 535 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  25.96 
 
 		 535 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.96 
 
 		 535 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.96 
 
 		 535 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.96 
 
 		 535 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  25.96 
 
 		 535 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.96 
 
 		 535 aa  146  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 489 aa  146  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  27.34 
 
 		 514 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 530 aa  144  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  28.18 
 
 		 513 aa  143  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.65 
 
 		 521 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.65 
 
 		 521 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 521 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.65 
 
 		 521 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 		 535 aa  141  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.35 
 
 		 535 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  26.47 
 
 		 595 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 538 aa  140  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  26.35 
 
 		 535 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  26.35 
 
 		 535 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 549 aa  140  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.65 
 
 		 521 aa  140  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.96 
 
 		 530 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  26.18 
 
 		 535 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 		 509 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 510 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  25.61 
 
 		 535 aa  139  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  24.83 
 
 		 532 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  24.72 
 
 		 526 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 531 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 535 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 528 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 		 535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 526 aa  134  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  24.4 
 
 		 522 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 544 aa  134  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  25.77 
 
 		 535 aa  134  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.95 
 
 		 526 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 528 aa  134  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.95 
 
 		 526 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.95 
 
 		 526 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.75 
 
 		 531 aa  133  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 528 aa  133  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.95 
 
 		 526 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  27.55 
 
 		 502 aa  133  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5289  ABC transporter  27.14 
 
 		 517 aa  133  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0912186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 533 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.49 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.74 
 
 		 526 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  25.55 
 
 		 516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  26.46 
 
 		 514 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  23.48 
 
 		 509 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  26.6 
 
 		 531 aa  130  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  26.39 
 
 		 499 aa  130  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 544 aa  130  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4734  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 521 aa  130  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2267  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.94 
 
 		 545 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  26.38 
 
 		 510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3508  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 553 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360798 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  25.77 
 
 		 497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  25.4 
 
 		 531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.41 
 
 		 506 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.81 
 
 		 542 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 535 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 		 495 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 530 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.9 
 
 		 518 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 		 494 aa  127  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 525 aa  127  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.93 
 
 		 520 aa  127  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  27 
 
 		 532 aa  127  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  24.22 
 
 		 525 aa  126  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  25.85 
 
 		 524 aa  126  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  24.5 
 
 		 531 aa  126  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  23.25 
 
 		 527 aa  126  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 530 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  26.77 
 
 		 532 aa  126  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.95 
 
 		 541 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0973  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 532 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 541 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 507 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 495 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 541 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  24.12 
 
 		 531 aa  124  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>