More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1968 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1968  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 518 aa  1067    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7174  peptide ABC transporter substrate-binding protein  61.89 
 
 		 503 aa  631  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4493  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 		 577 aa  276  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 507 aa  144  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 505 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.58 
 
 		 521 aa  144  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.58 
 
 		 521 aa  144  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.58 
 
 		 521 aa  144  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 521 aa  144  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.58 
 
 		 521 aa  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2267  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 506 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5289  ABC transporter  28.01 
 
 		 517 aa  139  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0912186  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.88 
 
 		 506 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  27.34 
 
 		 497 aa  137  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 549 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 509 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.45 
 
 		 521 aa  134  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3824  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 524 aa  134  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4734  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 521 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  25.48 
 
 		 533 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 521 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  25.65 
 
 		 519 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  25.49 
 
 		 532 aa  129  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.78 
 
 		 532 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  26.56 
 
 		 513 aa  127  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 521 aa  127  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 530 aa  127  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  25.35 
 
 		 514 aa  127  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 		 533 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  22.04 
 
 		 527 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  26.13 
 
 		 499 aa  124  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 		 535 aa  124  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  24.63 
 
 		 595 aa  123  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4082  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 526 aa  124  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484283  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 526 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  24.31 
 
 		 510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  24.16 
 
 		 526 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 495 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  23.74 
 
 		 530 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  24.41 
 
 		 520 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  26.77 
 
 		 502 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.19 
 
 		 534 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0028  extracellular solute-binding protein family 5  26.77 
 
 		 520 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183012 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1271  ABC transporter, periplasmic binding protein  27.53 
 
 		 528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000259921  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 489 aa  119  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 		 528 aa  117  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  24.15 
 
 		 516 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.32 
 
 		 518 aa  116  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 		 534 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.85 
 
 		 528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1920  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 607 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689476  normal  0.0152046 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4458  opine ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  25.49 
 
 		 526 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.124294  hitchhiker  0.0000632484 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.21 
 
 		 512 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  27.29 
 
 		 533 aa  114  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.71 
 
 		 511 aa  114  5e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.44 
 
 		 535 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  23.63 
 
 		 522 aa  114  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  21.12 
 
 		 528 aa  114  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  24.24 
 
 		 535 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  24.24 
 
 		 535 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  24.24 
 
 		 535 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  24.24 
 
 		 535 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.24 
 
 		 535 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.24 
 
 		 535 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.24 
 
 		 535 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.24 
 
 		 535 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 494 aa  113  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3112  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 505 aa  113  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 498 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3387  extracellular solute-binding protein family 5  27.23 
 
 		 550 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  21.28 
 
 		 535 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1994  ABC transporter, substrate-binding protein  24.73 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2595  putative extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 507 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975919 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  24.73 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  24.58 
 
 		 558 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 		 535 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0184  extracellular solute-binding protein family 5  25.58 
 
 		 518 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1077  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 522 aa  111  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 525 aa  110  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 539 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  24.19 
 
 		 525 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4134  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 516 aa  109  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2972  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 535 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  27.23 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.61 
 
 		 535 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2471  putative ABC transporter periplasmic binding protein  27.35 
 
 		 530 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10018 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  24.54 
 
 		 537 aa  109  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  24.61 
 
 		 535 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  22.46 
 
 		 532 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.67 
 
 		 520 aa  109  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 520 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  24.61 
 
 		 535 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  21.77 
 
 		 509 aa  108  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>