More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0184 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0184  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 518 aa  1040    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0252  extracellular solute-binding protein family 5  42.23 
 
 		 546 aa  365  1e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  31.57 
 
 		 505 aa  247  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  28.46 
 
 		 527 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  31.43 
 
 		 532 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 526 aa  203  6e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 495 aa  193  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  29.5 
 
 		 532 aa  183  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  27.71 
 
 		 516 aa  177  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 		 499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 		 520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 529 aa  174  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 495 aa  171  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  28.97 
 
 		 527 aa  170  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3737  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 517 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 526 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  27.4 
 
 		 595 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.27 
 
 		 528 aa  166  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 530 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  24.91 
 
 		 528 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 517 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  24.44 
 
 		 512 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  24.64 
 
 		 512 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  24.64 
 
 		 512 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  24.64 
 
 		 512 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.67 
 
 		 542 aa  162  9e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  25.31 
 
 		 509 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 		 526 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  24.44 
 
 		 512 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  25.56 
 
 		 518 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  27.94 
 
 		 528 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 535 aa  160  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 526 aa  160  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 520 aa  160  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 527 aa  160  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  26.19 
 
 		 520 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  26.63 
 
 		 575 aa  159  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.63 
 
 		 534 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  24.57 
 
 		 514 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 528 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 		 514 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0217  extracellular solute-binding protein family 5  27.24 
 
 		 588 aa  157  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.745298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0028  extracellular solute-binding protein family 5  25.82 
 
 		 520 aa  157  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1024  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 524 aa  157  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  23.6 
 
 		 512 aa  156  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  23.6 
 
 		 512 aa  156  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  26.58 
 
 		 519 aa  156  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.78 
 
 		 520 aa  156  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  23.6 
 
 		 512 aa  156  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 		 520 aa  156  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 523 aa  155  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  23.4 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  23.98 
 
 		 520 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  23.6 
 
 		 512 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  23.4 
 
 		 512 aa  154  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.35 
 
 		 520 aa  154  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  25.97 
 
 		 523 aa  154  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  23.4 
 
 		 512 aa  154  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.35 
 
 		 524 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  23.48 
 
 		 514 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 507 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  25.69 
 
 		 533 aa  153  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 556 aa  153  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  26.46 
 
 		 531 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.26 
 
 		 493 aa  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 		 514 aa  151  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 512 aa  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  25.05 
 
 		 520 aa  150  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  24.41 
 
 		 497 aa  150  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.16 
 
 		 520 aa  149  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  24.54 
 
 		 528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  25.44 
 
 		 517 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 514 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 510 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 538 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 528 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  26.67 
 
 		 514 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 520 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 520 aa  147  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 521 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.16 
 
 		 530 aa  146  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  24.24 
 
 		 520 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  24.24 
 
 		 520 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  24.24 
 
 		 520 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  24.24 
 
 		 520 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.33 
 
 		 528 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 520 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  24.24 
 
 		 520 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  24.24 
 
 		 520 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  24.24 
 
 		 520 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  24.59 
 
 		 532 aa  145  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 512 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  25.57 
 
 		 513 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.84 
 
 		 535 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  25.06 
 
 		 526 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 532 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>