More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0095 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  74.27 
 
 		 542 aa  825    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  59.92 
 
 		 514 aa  648    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  59.38 
 
 		 516 aa  646    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  65.04 
 
 		 526 aa  682    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 517 aa  1073    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  80.85 
 
 		 519 aa  873    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  76.69 
 
 		 518 aa  860    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  65.72 
 
 		 520 aa  686    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  80.27 
 
 		 517 aa  869    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  61.05 
 
 		 595 aa  634  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  54.37 
 
 		 520 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  54.11 
 
 		 520 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  52.42 
 
 		 514 aa  551  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  37.25 
 
 		 526 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  36.12 
 
 		 527 aa  325  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  36.36 
 
 		 528 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  36.31 
 
 		 526 aa  309  9e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  36.87 
 
 		 531 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  36.22 
 
 		 538 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  34.24 
 
 		 524 aa  293  4e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  35.74 
 
 		 527 aa  293  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  35.27 
 
 		 529 aa  291  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  36.09 
 
 		 526 aa  291  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  36.75 
 
 		 460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  33.46 
 
 		 532 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  34.76 
 
 		 528 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  34.76 
 
 		 528 aa  284  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  34.7 
 
 		 544 aa  282  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  35.54 
 
 		 528 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1815  extracellular solute-binding protein  35.28 
 
 		 532 aa  280  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 		 517 aa  277  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  33.74 
 
 		 526 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  33.74 
 
 		 526 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  35.15 
 
 		 530 aa  273  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  32.74 
 
 		 523 aa  269  8.999999999999999e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  32.54 
 
 		 523 aa  266  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  33 
 
 		 528 aa  264  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  33.78 
 
 		 528 aa  263  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  31.93 
 
 		 556 aa  261  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  32.28 
 
 		 514 aa  258  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0422  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 		 527 aa  257  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147362  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 		 528 aa  257  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  31.32 
 
 		 509 aa  256  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 		 520 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  31.57 
 
 		 535 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  31.42 
 
 		 516 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  31.83 
 
 		 516 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0423  extracellular solute-binding protein  33.27 
 
 		 527 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204725  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  33.87 
 
 		 526 aa  248  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 		 535 aa  246  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  31.3 
 
 		 512 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.85 
 
 		 530 aa  239  9e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  29.12 
 
 		 537 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  29.29 
 
 		 533 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  29.48 
 
 		 533 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  33 
 
 		 521 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.22 
 
 		 521 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 		 531 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  31.52 
 
 		 532 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 		 524 aa  217  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  31.52 
 
 		 528 aa  217  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  31.72 
 
 		 532 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  32.19 
 
 		 525 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 		 531 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  30.61 
 
 		 526 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 		 549 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 538 aa  211  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  31.34 
 
 		 535 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  31.31 
 
 		 522 aa  206  9e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  30.27 
 
 		 534 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  29.44 
 
 		 527 aa  200  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 544 aa  197  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.25 
 
 		 532 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 528 aa  189  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.91 
 
 		 521 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.91 
 
 		 521 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.91 
 
 		 521 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.91 
 
 		 521 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 521 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.8 
 
 		 520 aa  188  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 515 aa  182  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 505 aa  177  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  28.82 
 
 		 535 aa  176  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  29.04 
 
 		 534 aa  176  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  27.99 
 
 		 509 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  28.24 
 
 		 531 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 534 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  30.32 
 
 		 524 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0252  extracellular solute-binding protein family 5  28.07 
 
 		 546 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2474  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 525 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  28.34 
 
 		 575 aa  172  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.32 
 
 		 535 aa  172  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  27.59 
 
 		 535 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  28.12 
 
 		 535 aa  171  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  28.12 
 
 		 535 aa  171  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0184  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 		 518 aa  171  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  28.12 
 
 		 535 aa  171  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.12 
 
 		 535 aa  171  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.12 
 
 		 535 aa  171  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  28.12 
 
 		 535 aa  171  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>