More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0252 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0252  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 546 aa  1104    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0184  extracellular solute-binding protein family 5  45.11 
 
 		 518 aa  363  4e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 		 505 aa  190  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  29.64 
 
 		 527 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 		 526 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 		 495 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  30.05 
 
 		 526 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 517 aa  162  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.06 
 
 		 532 aa  162  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  27.93 
 
 		 528 aa  162  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  26.24 
 
 		 518 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  26.94 
 
 		 528 aa  161  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 		 528 aa  159  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  27.57 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  26.83 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  27.29 
 
 		 595 aa  159  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 538 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 509 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  30.05 
 
 		 527 aa  157  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.69 
 
 		 542 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 		 529 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 527 aa  156  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 535 aa  156  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  28.12 
 
 		 531 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  28.12 
 
 		 532 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 556 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  29.59 
 
 		 517 aa  154  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 526 aa  154  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 526 aa  154  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 530 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  29.29 
 
 		 519 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 535 aa  151  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  25.98 
 
 		 533 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 517 aa  150  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 		 533 aa  150  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 		 520 aa  147  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1815  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 532 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  28.06 
 
 		 532 aa  146  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.71 
 
 		 528 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.98 
 
 		 530 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 495 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  27.97 
 
 		 523 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 523 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.56 
 
 		 520 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 528 aa  143  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  26 
 
 		 528 aa  143  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  28.61 
 
 		 514 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 528 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 524 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  26.63 
 
 		 514 aa  141  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 509 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 528 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  25.33 
 
 		 520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  25.53 
 
 		 526 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 526 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  24.94 
 
 		 497 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 514 aa  136  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  27.99 
 
 		 575 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 512 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 520 aa  135  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  27.84 
 
 		 523 aa  135  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 512 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3737  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 517 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 512 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.44 
 
 		 512 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 522 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  30.64 
 
 		 568 aa  133  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 531 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.14 
 
 		 510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.11 
 
 		 520 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  25.17 
 
 		 524 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  24.36 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.7 
 
 		 535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  25.48 
 
 		 516 aa  131  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  25.63 
 
 		 509 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 544 aa  131  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  24.37 
 
 		 512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 		 510 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  26.54 
 
 		 520 aa  130  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  26.13 
 
 		 499 aa  130  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  24.55 
 
 		 517 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 520 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  27.56 
 
 		 460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  25.48 
 
 		 516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 520 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 520 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 510 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.98 
 
 		 505 aa  127  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 519 aa  127  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 520 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 509 aa  126  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 515 aa  126  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  24.31 
 
 		 520 aa  126  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 520 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 520 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.06 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 520 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  23.53 
 
 		 517 aa  124  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  26.46 
 
 		 516 aa  123  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>