More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5070 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 495 aa  1003    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  65.45 
 
 		 495 aa  676    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  34.33 
 
 		 505 aa  261  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  29.64 
 
 		 499 aa  219  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  30.58 
 
 		 526 aa  210  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  30.6 
 
 		 522 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 509 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  29.32 
 
 		 497 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  29.55 
 
 		 527 aa  205  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4029  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 502 aa  203  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  29.49 
 
 		 525 aa  200  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5411  extracellular solute-binding protein family 5  29.64 
 
 		 506 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.253312  decreased coverage  0.00154474 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5344  extracellular solute-binding protein family 5  29.94 
 
 		 506 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.297716  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3985  extracellular solute-binding protein  30.72 
 
 		 499 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0184  extracellular solute-binding protein family 5  28.31 
 
 		 518 aa  193  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1024  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 524 aa  193  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5080  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 502 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0526207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5398  extracellular solute-binding protein family 5  31.17 
 
 		 506 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 509 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0028  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 		 520 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183012 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  33.16 
 
 		 492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 		 549 aa  183  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 528 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  29.03 
 
 		 524 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 528 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.4 
 
 		 492 aa  179  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.52 
 
 		 479 aa  178  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.89 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 525 aa  176  7e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 521 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.94 
 
 		 521 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 528 aa  173  7.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  29.77 
 
 		 524 aa  172  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 544 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  30.55 
 
 		 509 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 		 535 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  28.13 
 
 		 533 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 527 aa  171  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  31.31 
 
 		 537 aa  171  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 526 aa  170  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 		 535 aa  170  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.12 
 
 		 510 aa  170  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 		 489 aa  170  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 526 aa  170  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 556 aa  169  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  32.47 
 
 		 520 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  27.98 
 
 		 526 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  26.59 
 
 		 514 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 		 534 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.43 
 
 		 520 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 528 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 528 aa  167  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  25.84 
 
 		 516 aa  167  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 526 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1950  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 		 506 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412794  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  29.14 
 
 		 528 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.95 
 
 		 530 aa  166  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  33.16 
 
 		 501 aa  166  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  30.83 
 
 		 528 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  31.17 
 
 		 520 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 532 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 512 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 512 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 512 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0252  extracellular solute-binding protein family 5  31.94 
 
 		 546 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  27.24 
 
 		 531 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  25.25 
 
 		 516 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.56 
 
 		 542 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  30.32 
 
 		 531 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  28.05 
 
 		 532 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  27.93 
 
 		 523 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  28.54 
 
 		 520 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 		 533 aa  163  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 511 aa  163  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 531 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  32.49 
 
 		 499 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 521 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4355  extracellular solute-binding protein family 5  32.11 
 
 		 495 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0355555  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 538 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 507 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  28.45 
 
 		 516 aa  161  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1949  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 		 506 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 508 aa  161  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 531 aa  161  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 529 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  29.74 
 
 		 544 aa  160  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.81 
 
 		 532 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.56 
 
 		 508 aa  160  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 544 aa  160  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 530 aa  160  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 493 aa  160  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.77 
 
 		 510 aa  159  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  29.06 
 
 		 532 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  29.43 
 
 		 532 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.86 
 
 		 521 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  28.39 
 
 		 509 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 510 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 		 513 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3737  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 517 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  29.53 
 
 		 532 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>