More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1873 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  61.46 
 
 		 542 aa  651    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  61.11 
 
 		 517 aa  646    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  60.12 
 
 		 595 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 526 aa  1089    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  64.5 
 
 		 516 aa  689    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  61.49 
 
 		 519 aa  652    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  65.04 
 
 		 517 aa  667    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  63.69 
 
 		 514 aa  678    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  59.35 
 
 		 518 aa  650    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  71.95 
 
 		 520 aa  761    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  54.4 
 
 		 514 aa  605  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  55.6 
 
 		 520 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  52.19 
 
 		 520 aa  553  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  37.05 
 
 		 526 aa  327  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  37.15 
 
 		 527 aa  327  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  37.4 
 
 		 526 aa  325  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  37.38 
 
 		 531 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  37.33 
 
 		 528 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  36.54 
 
 		 527 aa  302  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  36.31 
 
 		 538 aa  299  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  35.17 
 
 		 532 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  33.14 
 
 		 528 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  32.95 
 
 		 528 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  34.5 
 
 		 529 aa  286  8e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1815  extracellular solute-binding protein  37.03 
 
 		 532 aa  286  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 		 523 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  35.5 
 
 		 526 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  34 
 
 		 523 aa  283  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  36.22 
 
 		 460 aa  282  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  31.93 
 
 		 535 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  32.46 
 
 		 509 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 		 528 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  32.46 
 
 		 535 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 		 528 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 		 524 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 530 aa  273  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  35.84 
 
 		 544 aa  273  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  34.91 
 
 		 528 aa  271  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  32.67 
 
 		 556 aa  269  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  33.95 
 
 		 526 aa  269  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  33.95 
 
 		 526 aa  269  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  33.2 
 
 		 530 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 		 520 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  32.11 
 
 		 533 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  32.11 
 
 		 533 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  32.04 
 
 		 517 aa  253  7e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  31.81 
 
 		 516 aa  252  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  30.44 
 
 		 528 aa  249  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  31.21 
 
 		 516 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  32.61 
 
 		 526 aa  242  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  31.64 
 
 		 514 aa  240  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  30.22 
 
 		 512 aa  232  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 		 521 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 531 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0422  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 527 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147362  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  29.98 
 
 		 524 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0423  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 		 527 aa  226  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204725  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.34 
 
 		 521 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 538 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 531 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  30.44 
 
 		 532 aa  213  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  30.44 
 
 		 532 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  29.44 
 
 		 528 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  29.32 
 
 		 537 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  31.64 
 
 		 549 aa  212  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  29.52 
 
 		 527 aa  206  9e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  31.14 
 
 		 526 aa  206  9e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  31.29 
 
 		 522 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 544 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  30.64 
 
 		 505 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0184  extracellular solute-binding protein family 5  31.25 
 
 		 518 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.98 
 
 		 534 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  31.09 
 
 		 520 aa  197  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  30.15 
 
 		 525 aa  196  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.55 
 
 		 535 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  29.03 
 
 		 575 aa  189  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 		 528 aa  188  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  30.75 
 
 		 509 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 534 aa  183  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.48 
 
 		 532 aa  179  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 534 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 515 aa  177  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.63 
 
 		 521 aa  177  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.41 
 
 		 521 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.41 
 
 		 521 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.41 
 
 		 521 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 521 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2474  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 525 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  29.46 
 
 		 524 aa  174  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0252  extracellular solute-binding protein family 5  30.19 
 
 		 546 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.67 
 
 		 541 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  28.57 
 
 		 512 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  28.57 
 
 		 512 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  28.57 
 
 		 512 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  28.38 
 
 		 512 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  28.19 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  29.07 
 
 		 497 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  29.04 
 
 		 520 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  27.88 
 
 		 532 aa  167  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.29 
 
 		 512 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>