More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0244 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 575 aa  1167    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0217  extracellular solute-binding protein family 5  57.44 
 
 		 588 aa  664    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.745298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  35.48 
 
 		 524 aa  312  1e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  32.32 
 
 		 534 aa  308  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  33.13 
 
 		 535 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  34.15 
 
 		 565 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  34.24 
 
 		 532 aa  290  7e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  31.76 
 
 		 541 aa  273  9e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 		 530 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  34.41 
 
 		 532 aa  263  8e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  29.56 
 
 		 535 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  29.56 
 
 		 535 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  29.56 
 
 		 535 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.56 
 
 		 535 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  29.56 
 
 		 535 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.56 
 
 		 535 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.56 
 
 		 535 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.37 
 
 		 535 aa  250  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 528 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  32.78 
 
 		 538 aa  246  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 		 532 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  30.3 
 
 		 546 aa  243  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  29.49 
 
 		 532 aa  243  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 547 aa  241  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.56 
 
 		 526 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.56 
 
 		 526 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.56 
 
 		 526 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  30.65 
 
 		 535 aa  240  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.56 
 
 		 526 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  30.04 
 
 		 535 aa  239  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.37 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 535 aa  236  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  28.94 
 
 		 531 aa  236  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  28.8 
 
 		 535 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  29.84 
 
 		 535 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  31.13 
 
 		 532 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 		 532 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 535 aa  234  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  31.61 
 
 		 542 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  30.44 
 
 		 545 aa  233  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  30.27 
 
 		 547 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  32.13 
 
 		 526 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  29.86 
 
 		 523 aa  228  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.98 
 
 		 535 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  27.98 
 
 		 535 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  27.98 
 
 		 535 aa  224  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.75 
 
 		 547 aa  224  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 544 aa  222  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 531 aa  221  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 532 aa  220  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 532 aa  219  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 531 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 529 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2580  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 		 541 aa  216  8e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 547 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 		 531 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3775  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.41 
 
 		 556 aa  214  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1949  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 542 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0969647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.49 
 
 		 521 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.49 
 
 		 521 aa  213  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 521 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.49 
 
 		 521 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4561  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.4 
 
 		 531 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 506 aa  213  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3963  hypothetical protein  31.65 
 
 		 508 aa  212  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.81037  normal  0.136891 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  29.42 
 
 		 544 aa  212  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 531 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.31 
 
 		 521 aa  211  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 541 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  27.46 
 
 		 533 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 543 aa  210  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  27.88 
 
 		 531 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  27.91 
 
 		 537 aa  210  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  27.68 
 
 		 533 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1235  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.58 
 
 		 542 aa  209  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650831  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  27.33 
 
 		 537 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  29.98 
 
 		 508 aa  207  6e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 530 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3006  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 544 aa  206  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  27.44 
 
 		 531 aa  204  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  29.05 
 
 		 531 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  28.4 
 
 		 532 aa  204  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1805  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.22 
 
 		 525 aa  203  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4238  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 531 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26.48 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 531 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  28.45 
 
 		 531 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  27.8 
 
 		 532 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  28.12 
 
 		 541 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 542 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.39 
 
 		 530 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 		 541 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  26.64 
 
 		 533 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 531 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1604  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 525 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.05 
 
 		 528 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1638  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 525 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  27.03 
 
 		 531 aa  200  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 541 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 523 aa  199  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>