More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3775 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3775  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  100 
 
 		 556 aa  1157    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  47.29 
 
 		 547 aa  526  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3006  extracellular solute-binding protein  46.52 
 
 		 544 aa  525  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  48.76 
 
 		 551 aa  522  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  49.62 
 
 		 541 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1604  extracellular solute-binding protein  49.81 
 
 		 525 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  49.24 
 
 		 541 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  49.43 
 
 		 541 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1638  extracellular solute-binding protein  49.81 
 
 		 525 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  49.62 
 
 		 541 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  49.05 
 
 		 541 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1805  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  50.3 
 
 		 525 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2482  extracellular solute-binding protein  47.89 
 
 		 582 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3102  extracellular solute-binding protein  48.95 
 
 		 549 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.522775  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1500  extracellular solute-binding protein  47.91 
 
 		 541 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  47.41 
 
 		 542 aa  504  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2580  extracellular solute-binding protein  46.77 
 
 		 541 aa  502  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02835  putative ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  44.46 
 
 		 578 aa  495  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  43.94 
 
 		 535 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1235  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  48.2 
 
 		 542 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650831  normal  0.763441 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  43.37 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  43.37 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  43.94 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  43.37 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  43.37 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  43.56 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  43.37 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  43.37 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  43.18 
 
 		 535 aa  488  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  42.8 
 
 		 526 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  43.75 
 
 		 535 aa  484  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  43.76 
 
 		 535 aa  480  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  42.61 
 
 		 535 aa  481  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  42.61 
 
 		 526 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  42.61 
 
 		 526 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  45.74 
 
 		 530 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  42.61 
 
 		 526 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  42.61 
 
 		 526 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  42.8 
 
 		 535 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  42.8 
 
 		 535 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  42.8 
 
 		 535 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  42.42 
 
 		 535 aa  474  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  44.62 
 
 		 531 aa  465  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  44.09 
 
 		 506 aa  464  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  43.75 
 
 		 531 aa  461  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  43.43 
 
 		 531 aa  457  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  42.29 
 
 		 531 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  42.49 
 
 		 531 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0973  extracellular solute-binding protein  42.89 
 
 		 532 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  42.46 
 
 		 532 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  42.46 
 
 		 532 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  41.98 
 
 		 532 aa  440  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  40.82 
 
 		 547 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  43.74 
 
 		 529 aa  438  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  42.72 
 
 		 538 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  40.15 
 
 		 533 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  41.31 
 
 		 542 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  41.51 
 
 		 542 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  41.19 
 
 		 537 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  40.08 
 
 		 533 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1752  extracellular solute-binding protein family 5  40.77 
 
 		 582 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 543 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1892  extracellular solute-binding protein  43.65 
 
 		 547 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110335  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2540  peptide transport periplasmic protein precursor  43.56 
 
 		 548 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  40.72 
 
 		 531 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  40.75 
 
 		 547 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1784  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  43.65 
 
 		 547 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1817  peptide transport periplasmic protein SapA  40.98 
 
 		 549 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.690019  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  39.37 
 
 		 547 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3508  extracellular solute-binding protein  42.35 
 
 		 553 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2342  extracellular solute-binding protein family 5  40.94 
 
 		 580 aa  424  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003816  peptide transport periplasmic protein SapA  41.65 
 
 		 539 aa  422  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  40.79 
 
 		 537 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01870  hypothetical protein  40.99 
 
 		 539 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  38.89 
 
 		 541 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  39.22 
 
 		 540 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  41.11 
 
 		 530 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0437  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  41.98 
 
 		 574 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217985  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2629  extracellular solute-binding protein  40.43 
 
 		 550 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.553559  normal  0.405199 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0243  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  41.98 
 
 		 542 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  39.3 
 
 		 541 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0256  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  41.98 
 
 		 542 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  38.7 
 
 		 541 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2613  extracellular solute-binding protein family 5  39.7 
 
 		 562 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0942045  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0220  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  40.47 
 
 		 542 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63568  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  40.55 
 
 		 531 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  38.7 
 
 		 541 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1718  extracellular solute-binding protein family 5  41.37 
 
 		 581 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264997  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4350  extracellular solute-binding protein  42.54 
 
 		 553 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.801154  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  40.76 
 
 		 542 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4016  extracellular solute-binding protein  42.54 
 
 		 553 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3301  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  41.82 
 
 		 542 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  38.79 
 
 		 542 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  40.71 
 
 		 530 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  39.69 
 
 		 532 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2121  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  41.82 
 
 		 536 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443402  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3378  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  41.82 
 
 		 542 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2969  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  41.82 
 
 		 542 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1640  peptide transport periplasmic protein SapA  40.78 
 
 		 549 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000341731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  40.76 
 
 		 531 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>