More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00493 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  80.85 
 
 
517 aa  874    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  74.08 
 
 
542 aa  820    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  100 
 
 
519 aa  1077    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  61.49 
 
 
526 aa  666    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  95.94 
 
 
517 aa  1018    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  59.19 
 
 
516 aa  636    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  72.06 
 
 
518 aa  805    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  67.34 
 
 
520 aa  691    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  59.14 
 
 
514 aa  632  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  60.78 
 
 
595 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  54.76 
 
 
520 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  56.39 
 
 
520 aa  571  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  51.35 
 
 
514 aa  550  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  36.47 
 
 
526 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  35.82 
 
 
527 aa  313  4.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  36.65 
 
 
524 aa  303  5.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  35.02 
 
 
528 aa  296  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  36.4 
 
 
531 aa  294  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  35.57 
 
 
538 aa  292  8e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  34.76 
 
 
526 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  34.33 
 
 
528 aa  291  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  34.15 
 
 
528 aa  289  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  33.84 
 
 
532 aa  283  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  34.46 
 
 
529 aa  282  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 
528 aa  281  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  35.28 
 
 
527 aa  280  6e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  35.29 
 
 
526 aa  280  6e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  36.89 
 
 
460 aa  280  7e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  35.32 
 
 
544 aa  279  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  34.73 
 
 
509 aa  279  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  33.59 
 
 
528 aa  276  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  34.12 
 
 
517 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1815  extracellular solute-binding protein  34.75 
 
 
532 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  33.27 
 
 
535 aa  272  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 
523 aa  268  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  34.33 
 
 
520 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  33.89 
 
 
526 aa  267  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  33.89 
 
 
526 aa  267  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  32.87 
 
 
523 aa  266  8e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  35.04 
 
 
530 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  33.53 
 
 
535 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  32.68 
 
 
556 aa  259  8e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  32.87 
 
 
514 aa  259  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  32.26 
 
 
528 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  33.68 
 
 
530 aa  256  7e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  32.81 
 
 
516 aa  254  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0422  extracellular solute-binding protein  33.98 
 
 
527 aa  252  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147362  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  31.42 
 
 
516 aa  249  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  32.11 
 
 
533 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  32.38 
 
 
512 aa  248  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  32.52 
 
 
533 aa  247  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  34.04 
 
 
528 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0423  extracellular solute-binding protein  33.96 
 
 
527 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204725  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 
526 aa  239  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 
521 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  29.69 
 
 
537 aa  227  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.94 
 
 
521 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 
524 aa  225  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  31.77 
 
 
531 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  30.52 
 
 
538 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  30.44 
 
 
528 aa  213  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  30.71 
 
 
532 aa  213  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  30.71 
 
 
532 aa  213  7e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 
531 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 
549 aa  210  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  31.62 
 
 
526 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  31.72 
 
 
522 aa  203  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.74 
 
 
535 aa  203  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  30.12 
 
 
532 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  30.6 
 
 
525 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  29.12 
 
 
534 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 
528 aa  194  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.62 
 
 
520 aa  193  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 
544 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 
505 aa  186  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.1 
 
 
521 aa  186  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
515 aa  185  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 
521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.71 
 
 
521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.71 
 
 
521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.71 
 
 
521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  27.52 
 
 
527 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 
534 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  29.16 
 
 
534 aa  180  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  28.75 
 
 
509 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  26.49 
 
 
575 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 
528 aa  171  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 
495 aa  171  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.11 
 
 
510 aa  170  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2474  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 
525 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  29.82 
 
 
502 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0184  extracellular solute-binding protein family 5  27.25 
 
 
518 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 
519 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0252  extracellular solute-binding protein family 5  28.36 
 
 
546 aa  163  7e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  28.99 
 
 
502 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0226  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 
533 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  29.92 
 
 
524 aa  161  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 
497 aa  159  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 
508 aa  159  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
512 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>