More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0663 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
526 aa  1092    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  79 
 
 
544 aa  892    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  99.43 
 
 
526 aa  1087    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  62.38 
 
 
531 aa  680    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  54.1 
 
 
528 aa  588  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  54.1 
 
 
528 aa  589  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  55.26 
 
 
528 aa  569  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  48.21 
 
 
528 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  46.11 
 
 
528 aa  478  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  46.33 
 
 
527 aa  472  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  45.84 
 
 
526 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  45.56 
 
 
526 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  42.21 
 
 
532 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1815  extracellular solute-binding protein  44.58 
 
 
532 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  43.06 
 
 
531 aa  411  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0422  extracellular solute-binding protein  42.64 
 
 
527 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147362  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  41.03 
 
 
527 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  41.32 
 
 
523 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  41.73 
 
 
538 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  41.32 
 
 
523 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  39.25 
 
 
526 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  40.12 
 
 
556 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0423  extracellular solute-binding protein  40.45 
 
 
527 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204725  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  36.43 
 
 
529 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  39.84 
 
 
528 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  40.53 
 
 
524 aa  362  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  38 
 
 
517 aa  350  3e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  36.67 
 
 
530 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  38.71 
 
 
526 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  34.31 
 
 
520 aa  322  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  36.88 
 
 
460 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  34.21 
 
 
514 aa  273  6e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  34.58 
 
 
595 aa  272  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 
526 aa  270  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  33.27 
 
 
516 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  33.53 
 
 
517 aa  269  8.999999999999999e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.55 
 
 
542 aa  262  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  33.2 
 
 
519 aa  262  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  32.81 
 
 
509 aa  259  6e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  33 
 
 
517 aa  259  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  32.87 
 
 
520 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 
528 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 
535 aa  256  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 
535 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  33.54 
 
 
520 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  31.37 
 
 
518 aa  253  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  33.27 
 
 
520 aa  253  6e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  32.39 
 
 
530 aa  253  8.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 
514 aa  249  8e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  30.71 
 
 
514 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  31.11 
 
 
533 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  32.35 
 
 
516 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  31.3 
 
 
533 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  32.07 
 
 
538 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 
531 aa  240  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  32.33 
 
 
526 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  33.01 
 
 
522 aa  240  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  32.12 
 
 
528 aa  239  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  31.92 
 
 
532 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  32.14 
 
 
516 aa  238  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  31.72 
 
 
532 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  31.25 
 
 
512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  33.06 
 
 
525 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2474  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 
525 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 
544 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  33.94 
 
 
524 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 
521 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  31.03 
 
 
537 aa  220  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.25 
 
 
521 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 
534 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 
549 aa  217  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  32.61 
 
 
534 aa  216  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 
515 aa  198  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  26.82 
 
 
527 aa  197  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.22 
 
 
534 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 
505 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.54 
 
 
535 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 
495 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.96 
 
 
521 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  28.84 
 
 
497 aa  172  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.96 
 
 
521 aa  171  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.96 
 
 
521 aa  171  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.96 
 
 
521 aa  171  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 
521 aa  171  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  28.14 
 
 
532 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.14 
 
 
535 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  28.14 
 
 
535 aa  164  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  28.14 
 
 
535 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 
547 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  28.6 
 
 
532 aa  160  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3737  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 
517 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 
535 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.15 
 
 
547 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  28.87 
 
 
531 aa  158  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 
547 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 
535 aa  157  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
509 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 
531 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26.44 
 
 
520 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  27.93 
 
 
510 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>