More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4392 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
521 aa  1061    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  33.06 
 
 
520 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  32.51 
 
 
524 aa  219  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  31.81 
 
 
505 aa  219  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  32.3 
 
 
519 aa  218  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  31.87 
 
 
509 aa  217  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  32.99 
 
 
512 aa  216  7e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  31.2 
 
 
541 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  31.35 
 
 
532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  31.29 
 
 
534 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  32.37 
 
 
521 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  32.37 
 
 
521 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  31.45 
 
 
520 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  32.37 
 
 
521 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  32.32 
 
 
535 aa  213  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  32.37 
 
 
521 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  31.41 
 
 
512 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  31.41 
 
 
512 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  31.41 
 
 
512 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  32.14 
 
 
521 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  31.41 
 
 
512 aa  210  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  32.56 
 
 
528 aa  210  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  31.41 
 
 
512 aa  209  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  31.41 
 
 
512 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  31.21 
 
 
512 aa  208  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  33.01 
 
 
517 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 
512 aa  208  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  31.21 
 
 
512 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.68 
 
 
508 aa  206  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  30.43 
 
 
520 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  31.02 
 
 
512 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  31.02 
 
 
512 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  31.02 
 
 
512 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 
520 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  31.02 
 
 
512 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  30.8 
 
 
531 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  33.12 
 
 
509 aa  204  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  31.42 
 
 
493 aa  203  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 
528 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  30.5 
 
 
520 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 
520 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 
520 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  29.94 
 
 
514 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  31.33 
 
 
544 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  32.32 
 
 
512 aa  200  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 
520 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  31.15 
 
 
526 aa  200  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 
520 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  30.25 
 
 
520 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  30.25 
 
 
520 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.25 
 
 
520 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.25 
 
 
520 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  30.25 
 
 
520 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.25 
 
 
520 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.25 
 
 
520 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  30.57 
 
 
514 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  30.92 
 
 
495 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 
520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  33.71 
 
 
502 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  32.85 
 
 
519 aa  195  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.48 
 
 
520 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  29.59 
 
 
520 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  29.89 
 
 
513 aa  194  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.94 
 
 
516 aa  192  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.19 
 
 
517 aa  192  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 
510 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  29.69 
 
 
513 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  30.15 
 
 
544 aa  191  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  32.24 
 
 
565 aa  190  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  30.62 
 
 
518 aa  190  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  32.49 
 
 
513 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 
520 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 
525 aa  187  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1408  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 
518 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00741999  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  29.81 
 
 
521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  29.34 
 
 
497 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  29.31 
 
 
509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.88 
 
 
510 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 
492 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  30.46 
 
 
517 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 
530 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 
556 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.68 
 
 
505 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 
506 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  30.35 
 
 
518 aa  179  8e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  28.69 
 
 
517 aa  179  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
516 aa  179  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 
492 aa  179  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 
500 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  29.35 
 
 
528 aa  178  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  32.1 
 
 
499 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 
517 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 
501 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  29.32 
 
 
526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  31.02 
 
 
529 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  30.69 
 
 
516 aa  173  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  30.92 
 
 
520 aa  173  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 
501 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  28.27 
 
 
508 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.25 
 
 
492 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>