More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5706 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5706  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
552 aa  1110    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5711  extracellular solute-binding protein family 5  48.5 
 
 
550 aa  518  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6175  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  45.45 
 
 
541 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2236  extracellular solute-binding protein family 5  40.19 
 
 
547 aa  361  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0669965  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5044  extracellular solute-binding protein family 5  41.95 
 
 
566 aa  356  6.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4848  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  38.11 
 
 
539 aa  352  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3349  extracellular solute-binding protein family 5  28.29 
 
 
559 aa  194  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109598  normal  0.0359992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5265  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  30.3 
 
 
515 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154423  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  28.25 
 
 
559 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  29.19 
 
 
519 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  29.51 
 
 
537 aa  156  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 
509 aa  156  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 
489 aa  154  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.94 
 
 
535 aa  153  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.25 
 
 
534 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 
512 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.36 
 
 
532 aa  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 
512 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 
512 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  31.06 
 
 
502 aa  150  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.18 
 
 
520 aa  150  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 
510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 
535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 
510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
538 aa  148  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 
533 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.8 
 
 
509 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 
495 aa  146  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 
535 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 
535 aa  144  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 
533 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  27.23 
 
 
509 aa  144  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
528 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  26.19 
 
 
513 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 
568 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 
515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6472  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  26.59 
 
 
495 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149439  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  28.48 
 
 
531 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.55 
 
 
521 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.55 
 
 
521 aa  140  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.55 
 
 
521 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  28.16 
 
 
516 aa  140  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 
521 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  27.55 
 
 
562 aa  139  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  25.77 
 
 
513 aa  139  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  28.41 
 
 
517 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  27.21 
 
 
502 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0139  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
502 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184027  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  27.88 
 
 
509 aa  139  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
538 aa  139  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.85 
 
 
539 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  24.46 
 
 
526 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.36 
 
 
521 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 
515 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.46 
 
 
510 aa  137  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.36 
 
 
540 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.14 
 
 
538 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 
540 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.54 
 
 
531 aa  136  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  24.03 
 
 
526 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  27.85 
 
 
514 aa  136  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.96 
 
 
540 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.01 
 
 
525 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.69 
 
 
530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.81 
 
 
525 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.75 
 
 
532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  25.62 
 
 
541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  26.14 
 
 
518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 
517 aa  135  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  25.96 
 
 
540 aa  135  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 
539 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2065  extracellular solute-binding protein family 5  28.14 
 
 
543 aa  134  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 
509 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 
528 aa  134  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 
519 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 
535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 
507 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 
528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  27.75 
 
 
545 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
540 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 
528 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
494 aa  131  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.65 
 
 
534 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
495 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.32 
 
 
529 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 
544 aa  130  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 
540 aa  130  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 
538 aa  130  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.69 
 
 
543 aa  130  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  26.49 
 
 
528 aa  130  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 
505 aa  130  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4505  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
538 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.347947 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 
493 aa  129  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.37 
 
 
558 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.53 
 
 
545 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  25.52 
 
 
518 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  26.65 
 
 
496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4355  extracellular solute-binding protein family 5  26.14 
 
 
495 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0355555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>