More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2885 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
528 aa  1050    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  67.36 
 
 
532 aa  719    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  68.06 
 
 
532 aa  701    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  67.66 
 
 
532 aa  698    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6093  extracellular solute-binding protein family 5  61.86 
 
 
528 aa  632  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5343  extracellular solute-binding protein  61.8 
 
 
535 aa  634  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220066  normal  0.0289508 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  49.12 
 
 
552 aa  508  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  45.21 
 
 
533 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  48.34 
 
 
528 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  42.5 
 
 
532 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  45.29 
 
 
529 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  44.89 
 
 
529 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  46.09 
 
 
529 aa  445  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  43.4 
 
 
525 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  43.43 
 
 
525 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  43.62 
 
 
525 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  44.31 
 
 
525 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  44.31 
 
 
525 aa  433  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  39.62 
 
 
532 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  41.79 
 
 
525 aa  425  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  41.59 
 
 
526 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  41.05 
 
 
526 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  41.05 
 
 
526 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  39.76 
 
 
545 aa  386  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  40.78 
 
 
549 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0865  extracellular solute-binding protein  38.51 
 
 
544 aa  342  9e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  36.61 
 
 
555 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  35.47 
 
 
558 aa  331  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  35.17 
 
 
554 aa  327  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  37.73 
 
 
533 aa  323  4e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.79 
 
 
558 aa  323  5e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  36.79 
 
 
545 aa  323  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  36.79 
 
 
558 aa  322  7e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.79 
 
 
558 aa  323  7e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  36.79 
 
 
558 aa  323  7e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  36.79 
 
 
543 aa  322  8e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.79 
 
 
543 aa  322  8e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.79 
 
 
543 aa  322  8e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  36.79 
 
 
543 aa  322  8e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  37.38 
 
 
547 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.59 
 
 
543 aa  318  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  35.91 
 
 
544 aa  316  6e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  36.83 
 
 
543 aa  316  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  36.83 
 
 
543 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  36.83 
 
 
543 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  36.83 
 
 
543 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  36.83 
 
 
543 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  35.61 
 
 
537 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  35.61 
 
 
537 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  35.61 
 
 
537 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  35.61 
 
 
537 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  35.28 
 
 
537 aa  312  7.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  35.61 
 
 
537 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  35.61 
 
 
537 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.22 
 
 
543 aa  312  9e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  35.61 
 
 
537 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  35.66 
 
 
525 aa  309  6.999999999999999e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  35.66 
 
 
545 aa  309  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  35.66 
 
 
545 aa  309  9e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  36.25 
 
 
538 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  36.25 
 
 
538 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  35.4 
 
 
537 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  36.25 
 
 
538 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  35.34 
 
 
547 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  34.48 
 
 
543 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  36.04 
 
 
560 aa  306  8.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  36.44 
 
 
561 aa  305  9.000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  35.52 
 
 
545 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  35.19 
 
 
558 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2148  extracellular solute-binding protein  35.21 
 
 
538 aa  305  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  36.04 
 
 
538 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  34.73 
 
 
536 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  33.81 
 
 
542 aa  301  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2611  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 
544 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.502409 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2654  extracellular solute-binding protein family 5  35.64 
 
 
544 aa  300  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.411058  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  34.17 
 
 
538 aa  296  5e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  35.34 
 
 
541 aa  295  9e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  35.44 
 
 
559 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  34.64 
 
 
535 aa  295  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  34.89 
 
 
556 aa  295  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  34.69 
 
 
556 aa  294  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  34.58 
 
 
537 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  34.38 
 
 
537 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  34.58 
 
 
537 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  34.17 
 
 
537 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  34.5 
 
 
545 aa  291  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  34.17 
 
 
537 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  32.65 
 
 
539 aa  290  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  33.47 
 
 
537 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1328  extracellular solute-binding protein  34.24 
 
 
534 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2319  extracellular solute-binding protein family 5  34.38 
 
 
538 aa  289  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1569  extracellular solute-binding protein  34.24 
 
 
534 aa  287  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199164  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  33.66 
 
 
544 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  35.49 
 
 
539 aa  280  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2286  extracellular solute-binding protein family 5  33.79 
 
 
545 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3311  putative binding protein  33.71 
 
 
535 aa  274  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43332  normal  0.120975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4331  putative binding protein  33.52 
 
 
535 aa  273  6e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0680  extracellular solute-binding protein family 5  33.52 
 
 
535 aa  273  7e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0677  putative binding protein  33.52 
 
 
535 aa  273  7e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02842  hypothetical protein  33.52 
 
 
535 aa  273  7e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.81173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>