More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_1000 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  100 
 
 
529 aa  1078    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  97.54 
 
 
528 aa  1028    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  97.16 
 
 
528 aa  1025    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  97.92 
 
 
528 aa  1031    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  96.79 
 
 
528 aa  1022    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  97.92 
 
 
529 aa  1058    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  97.54 
 
 
528 aa  1028    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  97.16 
 
 
529 aa  1038    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  98.11 
 
 
528 aa  1033    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 
538 aa  231  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.25 
 
 
538 aa  228  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  30.55 
 
 
546 aa  225  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.68 
 
 
540 aa  205  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 
540 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 
539 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  27.29 
 
 
576 aa  186  8e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  27.04 
 
 
534 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 
529 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
559 aa  184  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.36 
 
 
535 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.92 
 
 
534 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  28.98 
 
 
529 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  27.36 
 
 
533 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  29.87 
 
 
521 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  29.68 
 
 
521 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.68 
 
 
521 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  29.68 
 
 
521 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 
521 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  25.91 
 
 
532 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 
544 aa  174  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 
532 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 
528 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  29.03 
 
 
529 aa  173  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.78 
 
 
524 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 
498 aa  171  3e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.97 
 
 
542 aa  171  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.79 
 
 
510 aa  171  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 
528 aa  169  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4682  extracellular solute-binding protein family 5  29.61 
 
 
532 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 
544 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.71 
 
 
520 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 
551 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.91 
 
 
541 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  28.48 
 
 
533 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 
537 aa  166  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.47 
 
 
525 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 
544 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  25.67 
 
 
524 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.44 
 
 
532 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  27.69 
 
 
515 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.49 
 
 
512 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 
565 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.21 
 
 
534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 
511 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.94 
 
 
593 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 
546 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  29.09 
 
 
516 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
535 aa  163  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.29 
 
 
511 aa  163  6e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 
536 aa  163  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.78 
 
 
512 aa  163  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.34 
 
 
516 aa  163  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.78 
 
 
512 aa  163  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  29.29 
 
 
533 aa  163  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.57 
 
 
512 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  28.69 
 
 
514 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0409  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.96 
 
 
527 aa  162  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0352  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.96 
 
 
527 aa  162  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.57 
 
 
512 aa  161  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4796  extracellular solute-binding protein family 5  28.97 
 
 
532 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478428  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  28.89 
 
 
514 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.57 
 
 
512 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  26.57 
 
 
512 aa  161  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  29.02 
 
 
537 aa  161  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.76 
 
 
593 aa  161  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 
512 aa  161  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 
505 aa  161  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.23 
 
 
511 aa  161  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  26.57 
 
 
512 aa  161  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.43 
 
 
565 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  25.74 
 
 
579 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  27.5 
 
 
512 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  26.57 
 
 
493 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  26.56 
 
 
600 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.29 
 
 
593 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
512 aa  159  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  27.29 
 
 
512 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 
510 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.18 
 
 
535 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
526 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  27.29 
 
 
512 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  27.29 
 
 
512 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  27.29 
 
 
512 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  28.02 
 
 
527 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  26.98 
 
 
535 aa  158  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  26.98 
 
 
535 aa  158  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.98 
 
 
535 aa  158  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.94 
 
 
593 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.94 
 
 
593 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.8 
 
 
524 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>