More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3349 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3349  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
559 aa  1136    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109598  normal  0.0359992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  37.63 
 
 
559 aa  356  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5265  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  36.44 
 
 
515 aa  300  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154423  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2114  extracellular solute-binding protein family 5  32.24 
 
 
538 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.59472  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3169  extracellular solute-binding protein family 5  31.98 
 
 
529 aa  230  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5706  extracellular solute-binding protein family 5  28.88 
 
 
552 aa  189  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5711  extracellular solute-binding protein family 5  29.68 
 
 
550 aa  187  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6175  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  31.68 
 
 
541 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4848  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  30.43 
 
 
539 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5044  extracellular solute-binding protein family 5  30.87 
 
 
566 aa  180  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2236  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 
547 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0669965  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 
510 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
534 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 
534 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 
528 aa  156  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.2 
 
 
505 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 
544 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
512 aa  153  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
512 aa  153  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
512 aa  153  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 
523 aa  150  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 
522 aa  146  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
511 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 
527 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  25.87 
 
 
526 aa  145  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
526 aa  145  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 
534 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.09 
 
 
510 aa  144  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  29.68 
 
 
509 aa  144  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 
489 aa  143  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 
538 aa  143  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
526 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 
515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0130  extracellular solute-binding protein family 5  27.86 
 
 
542 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.76 
 
 
521 aa  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  26.96 
 
 
512 aa  141  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  26.74 
 
 
516 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  25.75 
 
 
514 aa  140  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  26.46 
 
 
514 aa  140  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 
521 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.56 
 
 
521 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.56 
 
 
521 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.56 
 
 
521 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 
519 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  26.11 
 
 
497 aa  139  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.63 
 
 
538 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.4 
 
 
512 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  25.4 
 
 
512 aa  137  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.4 
 
 
512 aa  137  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.4 
 
 
512 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  25.4 
 
 
512 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.38 
 
 
546 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.4 
 
 
512 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  25.37 
 
 
493 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
510 aa  136  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  28.7 
 
 
526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0360  extracellular solute-binding protein family 5  27.6 
 
 
506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
528 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.39 
 
 
565 aa  135  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  25.29 
 
 
518 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.21 
 
 
505 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25 
 
 
512 aa  134  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  25.84 
 
 
502 aa  134  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3973  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 
549 aa  134  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  26.05 
 
 
595 aa  134  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3267  extracellular solute-binding protein family 5  30.05 
 
 
534 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485271  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  27.83 
 
 
522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.11 
 
 
520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  24.55 
 
 
520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.95 
 
 
492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.68 
 
 
540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 
492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.95 
 
 
479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  25.58 
 
 
502 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  25.47 
 
 
526 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 
549 aa  131  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 
568 aa  131  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  25.8 
 
 
517 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 
526 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 
492 aa  130  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4050  extracellular solute-binding protein family 5  26.37 
 
 
548 aa  130  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  26.75 
 
 
544 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.48 
 
 
532 aa  130  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.28 
 
 
542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  25.64 
 
 
528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  29.28 
 
 
519 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2701  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 
534 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  23.71 
 
 
516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.83 
 
 
524 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
535 aa  128  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
526 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 
537 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 
544 aa  127  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  24.55 
 
 
525 aa  127  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
538 aa  127  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  26.86 
 
 
547 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.42 
 
 
504 aa  127  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  23.49 
 
 
516 aa  126  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>