More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3267 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1439  extracellular solute-binding protein family 5  78.11 
 
 		 540 aa  859    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1277  extracellular solute-binding protein  78.3 
 
 		 598 aa  859    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2701  extracellular solute-binding protein  92.88 
 
 		 534 aa  1005    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3267  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 534 aa  1095    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485271  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0655  extracellular solute-binding protein  79.49 
 
 		 540 aa  868    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3381  4-phytase  57.7 
 
 		 560 aa  630  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7150  putative oligopeptide ABC transporter (substrate binding protein)  58.1 
 
 		 557 aa  611  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.144912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0290  extracellular solute-binding protein  56.1 
 
 		 531 aa  611  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.752502  normal  0.021899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1218  extracellular solute-binding protein  55.04 
 
 		 555 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0270957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0226  extracellular solute-binding protein  54.08 
 
 		 533 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1219  extracellular solute-binding protein  54.51 
 
 		 531 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0111682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7151  ABC transporter substrate-binding protein  56.16 
 
 		 531 aa  599  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0225  extracellular solute-binding protein  54.66 
 
 		 553 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0832  4-phytase  54.36 
 
 		 553 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0405616  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0833  extracellular solute-binding protein family 5  55.31 
 
 		 532 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54369  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0853  extracellular solute-binding protein family 5  51.19 
 
 		 552 aa  571  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1932  extracellular solute-binding protein  51.69 
 
 		 586 aa  568  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3602  extracellular solute-binding protein  53.28 
 
 		 539 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.170805  hitchhiker  0.00309347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0497  extracellular solute-binding protein  52.95 
 
 		 539 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00026016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1603  extracellular solute-binding protein family 5  51.49 
 
 		 539 aa  554  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.654936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2065  extracellular solute-binding protein  51.15 
 
 		 605 aa  553  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.414534  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0380  extracellular solute-binding protein  50.48 
 
 		 566 aa  547  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3792  extracellular solute-binding protein  49.45 
 
 		 551 aa  538  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.639455  normal  0.694676 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3376  extracellular solute-binding protein family 5  47.98 
 
 		 552 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0900  4-phytase  46.53 
 
 		 533 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0202096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4619  4-phytase  47.65 
 
 		 544 aa  478  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  33.06 
 
 		 509 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  32.92 
 
 		 520 aa  217  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 		 528 aa  193  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  30.29 
 
 		 531 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 		 525 aa  165  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 		 521 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.2 
 
 		 535 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 517 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 526 aa  160  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0062  extracellular solute-binding protein family 5  27.86 
 
 		 521 aa  159  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 528 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 512 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 512 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 512 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  27.24 
 
 		 565 aa  156  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.48 
 
 		 534 aa  156  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 512 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 490 aa  155  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  30.44 
 
 		 509 aa  154  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 498 aa  154  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 528 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  29.06 
 
 		 510 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.57 
 
 		 510 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 495 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.36 
 
 		 520 aa  150  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  28.44 
 
 		 527 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  28.69 
 
 		 519 aa  150  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  28.1 
 
 		 495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  27.37 
 
 		 503 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 526 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 532 aa  148  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 505 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  27.85 
 
 		 502 aa  146  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 514 aa  146  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  30.92 
 
 		 522 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  29.79 
 
 		 497 aa  145  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  27.45 
 
 		 517 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  31.03 
 
 		 513 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 		 522 aa  144  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  28.72 
 
 		 547 aa  144  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 595 aa  143  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  31.94 
 
 		 513 aa  144  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 		 502 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  26.77 
 
 		 529 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.46 
 
 		 508 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  26.89 
 
 		 532 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  27.59 
 
 		 524 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  27.32 
 
 		 519 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.65 
 
 		 541 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  29.82 
 
 		 508 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2648  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 		 524 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 531 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 538 aa  142  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  28.6 
 
 		 495 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 		 528 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 532 aa  141  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  29.24 
 
 		 527 aa  141  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.34 
 
 		 541 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  28.49 
 
 		 509 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.82 
 
 		 521 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 541 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  26.5 
 
 		 519 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 		 516 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 		 526 aa  140  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 538 aa  140  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  26.5 
 
 		 532 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.6 
 
 		 521 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.6 
 
 		 521 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  27.65 
 
 		 546 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 		 521 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.31 
 
 		 528 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>