More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7151 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0833  extracellular solute-binding protein family 5  87.41 
 
 		 532 aa  956    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54369  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1603  extracellular solute-binding protein family 5  66.15 
 
 		 539 aa  731    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.654936  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3602  extracellular solute-binding protein  67.93 
 
 		 539 aa  717    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.170805  hitchhiker  0.00309347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0290  extracellular solute-binding protein  82.68 
 
 		 531 aa  882    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.752502  normal  0.021899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0226  extracellular solute-binding protein  86.67 
 
 		 533 aa  951    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1219  extracellular solute-binding protein  85.69 
 
 		 531 aa  953    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0111682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0497  extracellular solute-binding protein  68.38 
 
 		 539 aa  740    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00026016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7151  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 531 aa  1080    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3267  extracellular solute-binding protein family 5  55.83 
 
 		 534 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485271  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0655  extracellular solute-binding protein  56.63 
 
 		 540 aa  598  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2701  extracellular solute-binding protein  54.13 
 
 		 534 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1439  extracellular solute-binding protein family 5  54.06 
 
 		 540 aa  578  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1277  extracellular solute-binding protein  54.26 
 
 		 598 aa  580  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3381  4-phytase  52.4 
 
 		 560 aa  560  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7150  putative oligopeptide ABC transporter (substrate binding protein)  50.55 
 
 		 557 aa  551  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.144912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1218  extracellular solute-binding protein  50.19 
 
 		 555 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0270957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0832  4-phytase  48.98 
 
 		 553 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0405616  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0225  extracellular solute-binding protein  49.45 
 
 		 553 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1932  extracellular solute-binding protein  47.5 
 
 		 586 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0853  extracellular solute-binding protein family 5  47.3 
 
 		 552 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0380  extracellular solute-binding protein  48 
 
 		 566 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2065  extracellular solute-binding protein  48.84 
 
 		 605 aa  508  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.414534  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3376  extracellular solute-binding protein family 5  47.47 
 
 		 552 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3792  extracellular solute-binding protein  44.19 
 
 		 551 aa  465  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.639455  normal  0.694676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0900  4-phytase  43.48 
 
 		 533 aa  443  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0202096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4619  4-phytase  41.34 
 
 		 544 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.54 
 
 		 520 aa  189  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 		 528 aa  187  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.4 
 
 		 509 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  30.28 
 
 		 531 aa  180  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  30.26 
 
 		 535 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  29.22 
 
 		 534 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.74 
 
 		 520 aa  161  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  28.6 
 
 		 517 aa  160  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 526 aa  160  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  28.49 
 
 		 518 aa  160  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 517 aa  158  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  29.37 
 
 		 519 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 517 aa  156  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  30.15 
 
 		 519 aa  156  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  30.39 
 
 		 509 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.49 
 
 		 542 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 528 aa  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  28.67 
 
 		 495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  29.38 
 
 		 502 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 535 aa  147  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.08 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 531 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 535 aa  143  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 520 aa  143  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 526 aa  143  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 514 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  29.22 
 
 		 509 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  28.96 
 
 		 502 aa  142  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  29.09 
 
 		 521 aa  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.55 
 
 		 516 aa  141  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  30.08 
 
 		 495 aa  141  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 528 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.19 
 
 		 545 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.53 
 
 		 565 aa  140  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  29.04 
 
 		 510 aa  139  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.87 
 
 		 521 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.87 
 
 		 521 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.87 
 
 		 521 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 521 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 495 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.59 
 
 		 525 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 512 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 528 aa  137  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  27.07 
 
 		 510 aa  137  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  28.25 
 
 		 517 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 520 aa  136  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 490 aa  136  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0925  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 536 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  29.89 
 
 		 527 aa  136  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  27.86 
 
 		 528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.38 
 
 		 524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 		 533 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 531 aa  134  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 		 495 aa  134  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 		 519 aa  134  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  29.1 
 
 		 527 aa  134  5e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  28.32 
 
 		 534 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  29.4 
 
 		 509 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  27.91 
 
 		 544 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 522 aa  133  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 		 522 aa  133  9e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 532 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  27.15 
 
 		 537 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  28.85 
 
 		 513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  28.8 
 
 		 513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2648  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  28.28 
 
 		 528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  28.83 
 
 		 513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 498 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 		 519 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 526 aa  131  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>