More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0900 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4619  4-phytase  75.25 
 
 
544 aa  788    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0900  4-phytase  100 
 
 
533 aa  1091    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0202096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2701  extracellular solute-binding protein  47.45 
 
 
534 aa  485  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3267  extracellular solute-binding protein family 5  46.53 
 
 
534 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485271  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1277  extracellular solute-binding protein  46.86 
 
 
598 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1439  extracellular solute-binding protein family 5  46.86 
 
 
540 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0655  extracellular solute-binding protein  46.08 
 
 
540 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1932  extracellular solute-binding protein  43.59 
 
 
586 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0226  extracellular solute-binding protein  43.48 
 
 
533 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1219  extracellular solute-binding protein  43.26 
 
 
531 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0111682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0833  extracellular solute-binding protein family 5  44.62 
 
 
532 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54369  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1218  extracellular solute-binding protein  44.34 
 
 
555 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0270957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0380  extracellular solute-binding protein  43.62 
 
 
566 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0853  extracellular solute-binding protein family 5  42.94 
 
 
552 aa  448  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3381  4-phytase  44.12 
 
 
560 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0290  extracellular solute-binding protein  43.63 
 
 
531 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.752502  normal  0.021899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7151  ABC transporter substrate-binding protein  43.69 
 
 
531 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7150  putative oligopeptide ABC transporter (substrate binding protein)  42.73 
 
 
557 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.144912  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0832  4-phytase  42.33 
 
 
553 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0405616  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0225  extracellular solute-binding protein  43.07 
 
 
553 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2065  extracellular solute-binding protein  42.56 
 
 
605 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.414534  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3376  extracellular solute-binding protein family 5  40.26 
 
 
552 aa  415  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3792  extracellular solute-binding protein  39.58 
 
 
551 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.639455  normal  0.694676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3602  extracellular solute-binding protein  40.51 
 
 
539 aa  405  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.170805  hitchhiker  0.00309347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1603  extracellular solute-binding protein family 5  38.92 
 
 
539 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.654936  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0497  extracellular solute-binding protein  38.85 
 
 
539 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00026016 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  31.3 
 
 
509 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  31.03 
 
 
520 aa  182  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 
528 aa  166  9e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.25 
 
 
531 aa  156  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0062  extracellular solute-binding protein family 5  30.39 
 
 
521 aa  153  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 
512 aa  152  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 
520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.92 
 
 
535 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  27.56 
 
 
520 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  32.39 
 
 
519 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 
519 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.56 
 
 
520 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 
517 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.21 
 
 
566 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  27.95 
 
 
520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  26.86 
 
 
520 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  29.01 
 
 
513 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  29.2 
 
 
513 aa  140  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
520 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 
534 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 
510 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.67 
 
 
520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  26.67 
 
 
520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.67 
 
 
520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.67 
 
 
520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  26.67 
 
 
520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.67 
 
 
520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.67 
 
 
520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  29.12 
 
 
539 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
498 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.14 
 
 
505 aa  137  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  26.11 
 
 
543 aa  136  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  25.52 
 
 
514 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  32.04 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  33.33 
 
 
518 aa  135  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  25.52 
 
 
514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  27.52 
 
 
535 aa  131  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  27.31 
 
 
495 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2654  extracellular solute-binding protein family 5  28.42 
 
 
544 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.411058  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
520 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
520 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.52 
 
 
517 aa  130  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
520 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.43 
 
 
512 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 
509 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  26.25 
 
 
538 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 
520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 
505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  28.03 
 
 
516 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  26.45 
 
 
493 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  26.43 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.22 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.22 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.22 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  29.98 
 
 
510 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.22 
 
 
512 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 
514 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 
520 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 
542 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.95 
 
 
524 aa  127  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  27.78 
 
 
495 aa  127  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  28.27 
 
 
513 aa  127  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 
520 aa  127  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 
544 aa  127  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.39 
 
 
535 aa  127  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  33.04 
 
 
519 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3638  extracellular solute-binding protein family 5  29.17 
 
 
555 aa  126  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339986  normal  0.415005 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  26.19 
 
 
535 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.19 
 
 
535 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0925  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
536 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2648  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 
524 aa  126  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  28.18 
 
 
532 aa  126  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  27.13 
 
 
524 aa  126  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>