More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0290 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0226  extracellular solute-binding protein  84.13 
 
 		 533 aa  910    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1219  extracellular solute-binding protein  83.43 
 
 		 531 aa  911    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0111682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1603  extracellular solute-binding protein family 5  66.28 
 
 		 539 aa  733    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.654936  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0833  extracellular solute-binding protein family 5  83.94 
 
 		 532 aa  897    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54369  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3602  extracellular solute-binding protein  68.8 
 
 		 539 aa  738    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.170805  hitchhiker  0.00309347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7151  ABC transporter substrate-binding protein  82.78 
 
 		 531 aa  887    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0290  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 531 aa  1083    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.752502  normal  0.021899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0497  extracellular solute-binding protein  67.64 
 
 		 539 aa  744    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00026016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3267  extracellular solute-binding protein family 5  55.58 
 
 		 534 aa  620  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485271  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0655  extracellular solute-binding protein  55.42 
 
 		 540 aa  593  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2701  extracellular solute-binding protein  54.04 
 
 		 534 aa  588  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1439  extracellular solute-binding protein family 5  54.26 
 
 		 540 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1277  extracellular solute-binding protein  54.46 
 
 		 598 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3381  4-phytase  51.3 
 
 		 560 aa  555  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1218  extracellular solute-binding protein  49.36 
 
 		 555 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0270957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7150  putative oligopeptide ABC transporter (substrate binding protein)  49.45 
 
 		 557 aa  546  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.144912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0832  4-phytase  49.26 
 
 		 553 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0405616  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0853  extracellular solute-binding protein family 5  47.86 
 
 		 552 aa  534  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0225  extracellular solute-binding protein  48.51 
 
 		 553 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1932  extracellular solute-binding protein  47.24 
 
 		 586 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0380  extracellular solute-binding protein  47.89 
 
 		 566 aa  525  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2065  extracellular solute-binding protein  47.8 
 
 		 605 aa  519  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.414534  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3376  extracellular solute-binding protein family 5  46.48 
 
 		 552 aa  508  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3792  extracellular solute-binding protein  44.07 
 
 		 551 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.639455  normal  0.694676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0900  4-phytase  43.63 
 
 		 533 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0202096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4619  4-phytase  42.75 
 
 		 544 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  31.41 
 
 		 520 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.58 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 		 528 aa  186  8e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  30.15 
 
 		 531 aa  176  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.98 
 
 		 535 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  31.17 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 517 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 528 aa  163  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.85 
 
 		 534 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.05 
 
 		 520 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.21 
 
 		 542 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  29.26 
 
 		 519 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 535 aa  157  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 		 526 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 520 aa  151  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 		 495 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  29.9 
 
 		 495 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 528 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 521 aa  147  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 512 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.08 
 
 		 510 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 517 aa  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  29.11 
 
 		 524 aa  144  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 535 aa  144  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  27.64 
 
 		 519 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.73 
 
 		 565 aa  143  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.09 
 
 		 521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.09 
 
 		 521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.09 
 
 		 521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.33 
 
 		 516 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.09 
 
 		 521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  29.51 
 
 		 544 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  28.51 
 
 		 544 aa  141  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.44 
 
 		 525 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  26.38 
 
 		 518 aa  140  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  29.31 
 
 		 545 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 		 495 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  29.22 
 
 		 517 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 526 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 		 495 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 505 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 498 aa  137  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 		 517 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 520 aa  136  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  26.5 
 
 		 517 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  26.86 
 
 		 531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6175  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  28.82 
 
 		 541 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.03 
 
 		 524 aa  135  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  28.14 
 
 		 510 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  27.79 
 
 		 526 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  28.97 
 
 		 513 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  27.1 
 
 		 522 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  27.59 
 
 		 519 aa  133  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  28.57 
 
 		 495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.46 
 
 		 532 aa  133  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 526 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  27.69 
 
 		 502 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0062  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 		 521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  28.19 
 
 		 527 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  26.65 
 
 		 527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 514 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 525 aa  131  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 532 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  29.1 
 
 		 513 aa  131  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 		 503 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5289  ABC transporter  29.25 
 
 		 517 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0912186  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0925  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 536 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  26.79 
 
 		 497 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  27.86 
 
 		 502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.09 
 
 		 543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>