More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2701 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0655  extracellular solute-binding protein  79.88 
 
 		 540 aa  863    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2701  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 534 aa  1094    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3267  extracellular solute-binding protein family 5  92.88 
 
 		 534 aa  1030    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485271  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1277  extracellular solute-binding protein  78.7 
 
 		 598 aa  855    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1439  extracellular solute-binding protein family 5  78.5 
 
 		 540 aa  855    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3381  4-phytase  56.4 
 
 		 560 aa  615  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7150  putative oligopeptide ABC transporter (substrate binding protein)  55.21 
 
 		 557 aa  599  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.144912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0226  extracellular solute-binding protein  53.8 
 
 		 533 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1218  extracellular solute-binding protein  54.36 
 
 		 555 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0270957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1219  extracellular solute-binding protein  53.82 
 
 		 531 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0111682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0833  extracellular solute-binding protein family 5  55.03 
 
 		 532 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54369  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0832  4-phytase  53.62 
 
 		 553 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0405616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7151  ABC transporter substrate-binding protein  54.53 
 
 		 531 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0290  extracellular solute-binding protein  54.04 
 
 		 531 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.752502  normal  0.021899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0225  extracellular solute-binding protein  52.37 
 
 		 553 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0853  extracellular solute-binding protein family 5  51.01 
 
 		 552 aa  568  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1932  extracellular solute-binding protein  51.77 
 
 		 586 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0497  extracellular solute-binding protein  52.17 
 
 		 539 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00026016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3602  extracellular solute-binding protein  52.68 
 
 		 539 aa  557  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.170805  hitchhiker  0.00309347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1603  extracellular solute-binding protein family 5  51.09 
 
 		 539 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.654936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2065  extracellular solute-binding protein  51.34 
 
 		 605 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.414534  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0380  extracellular solute-binding protein  50.67 
 
 		 566 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3792  extracellular solute-binding protein  50.57 
 
 		 551 aa  531  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.639455  normal  0.694676 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3376  extracellular solute-binding protein family 5  48.07 
 
 		 552 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0900  4-phytase  46.9 
 
 		 533 aa  491  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0202096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4619  4-phytase  48.04 
 
 		 544 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  32.91 
 
 		 520 aa  216  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  32.99 
 
 		 509 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  31.4 
 
 		 531 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 		 528 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 490 aa  164  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0062  extracellular solute-binding protein family 5  28.39 
 
 		 521 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 525 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 517 aa  160  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 498 aa  160  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 521 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.49 
 
 		 535 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 528 aa  156  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  28.48 
 
 		 519 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  28.92 
 
 		 510 aa  154  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.27 
 
 		 534 aa  154  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 512 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 526 aa  153  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  29.55 
 
 		 522 aa  150  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 528 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  30.11 
 
 		 509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  28.22 
 
 		 503 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  30.92 
 
 		 522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  28.02 
 
 		 517 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 500 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.69 
 
 		 565 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.79 
 
 		 510 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  27.74 
 
 		 519 aa  146  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 		 517 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  28.14 
 
 		 527 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 532 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 595 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  27.93 
 
 		 495 aa  144  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 		 522 aa  144  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  32.02 
 
 		 513 aa  143  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.29 
 
 		 524 aa  143  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  29.05 
 
 		 527 aa  143  9e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 531 aa  143  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 		 526 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  26.77 
 
 		 502 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 		 497 aa  143  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  27.22 
 
 		 502 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 505 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  27.34 
 
 		 516 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  32.35 
 
 		 513 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.72 
 
 		 520 aa  141  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  30.27 
 
 		 529 aa  141  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.01 
 
 		 490 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 510 aa  140  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 531 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 		 519 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 532 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  28.07 
 
 		 541 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 531 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0422  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.81 
 
 		 528 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537378  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  25.54 
 
 		 505 aa  139  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  27.69 
 
 		 547 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.61 
 
 		 528 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2283  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.61 
 
 		 528 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0091  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.61 
 
 		 528 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2005  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.61 
 
 		 528 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.41 
 
 		 528 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  26.49 
 
 		 532 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3091  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.61 
 
 		 528 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 514 aa  137  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.33 
 
 		 531 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  29.53 
 
 		 525 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.89 
 
 		 508 aa  137  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  29.24 
 
 		 508 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  27.22 
 
 		 528 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>