More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0360 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0360  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
506 aa  1041    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  34.73 
 
 
510 aa  283  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  27.61 
 
 
519 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  29.82 
 
 
517 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  30.45 
 
 
524 aa  209  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  29.48 
 
 
516 aa  207  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  28.82 
 
 
522 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.38 
 
 
521 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 
528 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.38 
 
 
521 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.38 
 
 
521 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.38 
 
 
521 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 
521 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  29.5 
 
 
565 aa  197  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  29.77 
 
 
527 aa  193  5e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 
510 aa  190  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.66 
 
 
520 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.35 
 
 
510 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  30.39 
 
 
519 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 
511 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 
512 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  29.1 
 
 
526 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 
506 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  30.23 
 
 
516 aa  180  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 
512 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 
512 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 
512 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.66 
 
 
525 aa  179  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.15 
 
 
535 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27 
 
 
545 aa  176  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 
515 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  30.27 
 
 
502 aa  173  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 
520 aa  173  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  27.74 
 
 
531 aa  173  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.88 
 
 
541 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  31.18 
 
 
502 aa  170  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.07 
 
 
520 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 
519 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  29.77 
 
 
515 aa  169  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 
510 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 
494 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.46 
 
 
532 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.43 
 
 
524 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 
493 aa  166  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  29.35 
 
 
503 aa  166  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  28.13 
 
 
531 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.84 
 
 
509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 
517 aa  163  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.43 
 
 
529 aa  163  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 
531 aa  162  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 
534 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 
528 aa  162  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.15 
 
 
512 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.15 
 
 
512 aa  160  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.15 
 
 
512 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.05 
 
 
516 aa  160  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  25.16 
 
 
531 aa  160  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.15 
 
 
512 aa  160  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.83 
 
 
516 aa  160  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  27.15 
 
 
512 aa  160  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  27.15 
 
 
512 aa  160  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 
521 aa  160  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.95 
 
 
512 aa  160  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
512 aa  159  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  26.19 
 
 
513 aa  159  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  28.05 
 
 
516 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  28.05 
 
 
516 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 
516 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  25.83 
 
 
513 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.83 
 
 
516 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 
534 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.44 
 
 
493 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.44 
 
 
529 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2595  putative extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
507 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975919 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  28.47 
 
 
544 aa  159  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.83 
 
 
516 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
510 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  29.55 
 
 
529 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 
531 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
535 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  27.05 
 
 
518 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 
529 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 
512 aa  157  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 
490 aa  157  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27 
 
 
518 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  25.37 
 
 
531 aa  156  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  26.91 
 
 
523 aa  156  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  26.77 
 
 
532 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 
489 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  29.19 
 
 
529 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.31 
 
 
528 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.69 
 
 
528 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  26.61 
 
 
513 aa  154  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
525 aa  154  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 
529 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  24.44 
 
 
537 aa  153  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 
509 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  28.08 
 
 
524 aa  152  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0973  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 
532 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.11 
 
 
528 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>