More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0365 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0365  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 521 aa  1067    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.13 
 
 		 508 aa  193  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 534 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 535 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 		 519 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  29.88 
 
 		 509 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 510 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.17 
 
 		 510 aa  172  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 		 535 aa  171  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 511 aa  170  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  28.75 
 
 		 508 aa  170  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 		 536 aa  167  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 515 aa  166  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.26 
 
 		 541 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 		 495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 529 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  26.27 
 
 		 502 aa  163  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 		 522 aa  163  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 512 aa  163  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 512 aa  163  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 512 aa  163  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2014  twin-arginine translocation pathway signal  29.58 
 
 		 534 aa  161  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.533924  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  25.05 
 
 		 529 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  24.66 
 
 		 529 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  27.83 
 
 		 542 aa  157  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.66 
 
 		 521 aa  157  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.66 
 
 		 521 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.66 
 
 		 521 aa  157  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.66 
 
 		 521 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0507  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 		 537 aa  157  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 521 aa  157  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 544 aa  156  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.71 
 
 		 520 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  27.56 
 
 		 537 aa  156  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  25.11 
 
 		 505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 		 541 aa  154  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  25.88 
 
 		 509 aa  153  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 		 501 aa  153  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  26.65 
 
 		 516 aa  153  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.31 
 
 		 524 aa  153  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.83 
 
 		 532 aa  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 544 aa  151  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.85 
 
 		 540 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.76 
 
 		 507 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.17 
 
 		 534 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  26 
 
 		 515 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  28.01 
 
 		 536 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.78 
 
 		 534 aa  147  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  27.06 
 
 		 517 aa  147  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 537 aa  147  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.45 
 
 		 502 aa  146  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  26.14 
 
 		 533 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  26.38 
 
 		 537 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  24.34 
 
 		 528 aa  146  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  28.33 
 
 		 520 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 		 519 aa  146  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.76 
 
 		 535 aa  146  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.15 
 
 		 516 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.98 
 
 		 534 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 		 520 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 		 520 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 520 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 		 520 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 522 aa  144  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 492 aa  143  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 512 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 527 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 534 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  25.47 
 
 		 514 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 503 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.7 
 
 		 532 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 517 aa  141  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.1 
 
 		 512 aa  141  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.9 
 
 		 512 aa  141  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  25.89 
 
 		 524 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  27.97 
 
 		 497 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.35 
 
 		 503 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.73 
 
 		 540 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 		 509 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 521 aa  140  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  26.13 
 
 		 523 aa  140  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 531 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  25.3 
 
 		 533 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 510 aa  140  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 		 513 aa  140  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  26.75 
 
 		 531 aa  140  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.91 
 
 		 505 aa  140  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.64 
 
 		 520 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.64 
 
 		 520 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4327  putative ABC transporter, extracellular substrate binding protein  26.55 
 
 		 538 aa  140  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  25.95 
 
 		 517 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.64 
 
 		 520 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.64 
 
 		 520 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  28.64 
 
 		 520 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.64 
 
 		 520 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>