More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3427 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0232  extracellular solute-binding protein  66.94 
 
 		 517 aa  692    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3427  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 526 aa  1077    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  64.86 
 
 		 517 aa  698    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  35.68 
 
 		 527 aa  293  7e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  32.41 
 
 		 519 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  28.48 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  28.4 
 
 		 505 aa  188  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  28.48 
 
 		 495 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 490 aa  187  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  29.94 
 
 		 495 aa  186  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.09 
 
 		 521 aa  186  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.94 
 
 		 521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.94 
 
 		 521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.94 
 
 		 521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 		 500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.33 
 
 		 520 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.79 
 
 		 528 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  29.22 
 
 		 503 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.12 
 
 		 513 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 521 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.54 
 
 		 534 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  29.04 
 
 		 495 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.57 
 
 		 540 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.88 
 
 		 535 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 540 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  30.2 
 
 		 531 aa  170  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  28.09 
 
 		 512 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  33.01 
 
 		 514 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 509 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2510  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 		 519 aa  169  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  27.69 
 
 		 512 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  27.69 
 
 		 512 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  27.69 
 
 		 512 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  27.69 
 
 		 512 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 501 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 		 513 aa  166  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  26.38 
 
 		 513 aa  166  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  28.54 
 
 		 509 aa  166  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27 
 
 		 512 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  28.19 
 
 		 502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  25.89 
 
 		 490 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  28.61 
 
 		 540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  26.9 
 
 		 518 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  27 
 
 		 512 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  27 
 
 		 512 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5088  extracellular solute-binding protein family 5  26.4 
 
 		 553 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.416607 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 		 493 aa  161  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  27.01 
 
 		 513 aa  160  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2763  extracellular solute-binding protein family 5  27.76 
 
 		 518 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  26.89 
 
 		 493 aa  160  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  28.5 
 
 		 520 aa  160  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 519 aa  159  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  27.38 
 
 		 514 aa  159  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 528 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  26.16 
 
 		 517 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 510 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 515 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 517 aa  157  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 516 aa  156  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  26.69 
 
 		 502 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.57 
 
 		 510 aa  155  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 520 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 520 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 520 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  25.66 
 
 		 541 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  31.89 
 
 		 520 aa  154  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  27.79 
 
 		 516 aa  154  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.89 
 
 		 520 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 520 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26.55 
 
 		 524 aa  153  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 		 532 aa  153  8e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  31 
 
 		 520 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  30.1 
 
 		 520 aa  152  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 		 520 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 498 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  30.1 
 
 		 520 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.1 
 
 		 520 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 		 520 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 512 aa  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  30.1 
 
 		 520 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.1 
 
 		 520 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 		 538 aa  151  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.1 
 
 		 520 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.1 
 
 		 520 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  30.1 
 
 		 520 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 538 aa  150  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  28.4 
 
 		 502 aa  150  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 525 aa  150  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  25.72 
 
 		 565 aa  150  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>