More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2850 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 490 aa  1004    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  55.17 
 
 		 495 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  52.62 
 
 		 495 aa  501  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  50.72 
 
 		 503 aa  489  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  49.9 
 
 		 490 aa  482  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  50.21 
 
 		 502 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  49.58 
 
 		 502 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  46.15 
 
 		 500 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  46.36 
 
 		 498 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  44 
 
 		 501 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  39.47 
 
 		 495 aa  350  3e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  38.35 
 
 		 552 aa  339  7e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  35.07 
 
 		 517 aa  290  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4369  extracellular solute-binding protein family 5  33.75 
 
 		 536 aa  245  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  32.44 
 
 		 505 aa  236  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  32.14 
 
 		 534 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  31.73 
 
 		 535 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  31.89 
 
 		 520 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  32.79 
 
 		 521 aa  221  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 520 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 		 520 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 		 520 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 		 520 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 		 520 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 		 520 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2811  extracellular solute-binding protein family 5  30.87 
 
 		 540 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  31 
 
 		 502 aa  208  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  29.71 
 
 		 516 aa  204  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  30.72 
 
 		 514 aa  204  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  30.04 
 
 		 520 aa  203  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 		 512 aa  203  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  30.16 
 
 		 514 aa  203  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.16 
 
 		 520 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  30.16 
 
 		 520 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  30.16 
 
 		 520 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  30.16 
 
 		 520 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.16 
 
 		 520 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.16 
 
 		 520 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.16 
 
 		 520 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  34 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 		 516 aa  200  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  31.9 
 
 		 520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  33.4 
 
 		 508 aa  196  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  29.88 
 
 		 516 aa  196  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 520 aa  193  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.57 
 
 		 520 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.07 
 
 		 510 aa  193  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.66 
 
 		 508 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 519 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  31.24 
 
 		 509 aa  190  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  28.16 
 
 		 520 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 520 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 509 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  28.94 
 
 		 513 aa  187  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.16 
 
 		 521 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.16 
 
 		 521 aa  187  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 521 aa  187  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.16 
 
 		 521 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 512 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 512 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 512 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.29 
 
 		 532 aa  186  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  28.94 
 
 		 513 aa  186  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 		 517 aa  186  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.16 
 
 		 521 aa  186  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 512 aa  186  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 515 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 518 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.41 
 
 		 513 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1408  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 518 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00741999  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  27.82 
 
 		 519 aa  184  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 510 aa  183  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 510 aa  183  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.46 
 
 		 503 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 503 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  29.82 
 
 		 544 aa  182  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1189  4-phytase  28.16 
 
 		 523 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  29.5 
 
 		 512 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  28.93 
 
 		 517 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  29.5 
 
 		 512 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  29.5 
 
 		 512 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  28.57 
 
 		 517 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  29.5 
 
 		 512 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  29.5 
 
 		 512 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 509 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  29.16 
 
 		 544 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.6 
 
 		 512 aa  177  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.6 
 
 		 512 aa  176  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.6 
 
 		 512 aa  176  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 512 aa  176  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  28.6 
 
 		 512 aa  176  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.4 
 
 		 512 aa  176  9e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  28.6 
 
 		 493 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.6 
 
 		 512 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.57 
 
 		 517 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 		 511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 517 aa  175  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 510 aa  173  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0112  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 506 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>