More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3049 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3049  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 503 aa  1031    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4355  extracellular solute-binding protein family 5  44.47 
 
 		 495 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0355555  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4354  extracellular solute-binding protein family 5  46.79 
 
 		 497 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148655  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  45.92 
 
 		 495 aa  424  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0139  extracellular solute-binding protein  44.14 
 
 		 502 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  46.57 
 
 		 496 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  46.57 
 
 		 496 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6472  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  44.61 
 
 		 495 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5441  extracellular solute-binding protein  43 
 
 		 497 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.876365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  41.44 
 
 		 492 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.82 
 
 		 492 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41 
 
 		 479 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  39.96 
 
 		 493 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  40.72 
 
 		 492 aa  359  7e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  41.1 
 
 		 489 aa  351  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  39.48 
 
 		 494 aa  348  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  36.31 
 
 		 509 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  35.02 
 
 		 508 aa  334  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  36.36 
 
 		 508 aa  323  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  34.85 
 
 		 501 aa  253  5.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.16 
 
 		 507 aa  248  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  34.38 
 
 		 499 aa  243  5e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 		 507 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0459  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 		 504 aa  229  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435025  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  33.12 
 
 		 506 aa  219  7e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0919  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  30.75 
 
 		 539 aa  218  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.654123  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26350  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.83 
 
 		 526 aa  211  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228589 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  31.26 
 
 		 505 aa  212  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1058  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 563 aa  207  3e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 522 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  30.11 
 
 		 519 aa  186  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 510 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  29.78 
 
 		 512 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.8 
 
 		 520 aa  176  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 		 511 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.48 
 
 		 510 aa  174  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.5 
 
 		 534 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.56 
 
 		 505 aa  168  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  31.44 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 517 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 		 515 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.43 
 
 		 535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  28.83 
 
 		 515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25 
 
 		 521 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  30.02 
 
 		 531 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25 
 
 		 521 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25 
 
 		 521 aa  160  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 521 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25 
 
 		 521 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  31.9 
 
 		 529 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  29.67 
 
 		 546 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 538 aa  158  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.09 
 
 		 542 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  24 
 
 		 503 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 544 aa  158  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  29.2 
 
 		 495 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  27 
 
 		 495 aa  157  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 		 515 aa  156  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 519 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  27.8 
 
 		 509 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 505 aa  156  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  29.32 
 
 		 524 aa  155  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  29.22 
 
 		 523 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 509 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  29.03 
 
 		 528 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  28.98 
 
 		 523 aa  154  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 520 aa  153  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 528 aa  153  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.24 
 
 		 538 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 521 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 532 aa  151  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1443  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 517 aa  151  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.13157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  27.06 
 
 		 537 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.93 
 
 		 526 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.93 
 
 		 526 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.93 
 
 		 526 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 528 aa  150  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  27.06 
 
 		 537 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.95 
 
 		 532 aa  149  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4557  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.76 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.67 
 
 		 539 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.7 
 
 		 526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.7 
 
 		 526 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  28.24 
 
 		 533 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 		 535 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 520 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 520 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 595 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.64 
 
 		 541 aa  147  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  29.03 
 
 		 538 aa  147  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  28.29 
 
 		 516 aa  147  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  28.31 
 
 		 534 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 520 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 		 520 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.88 
 
 		 540 aa  146  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>