More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0780 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0780  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
511 aa  1037    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.142319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0449  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 
522 aa  233  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0426  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 
511 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  33.4 
 
 
527 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0422  extracellular solute-binding protein family 5  31.11 
 
 
517 aa  177  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.941021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1930  extracellular solute-binding protein family 5  28.07 
 
 
499 aa  168  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15113  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2763  extracellular solute-binding protein family 5  29.22 
 
 
518 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2510  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 
519 aa  154  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  28.02 
 
 
519 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  31.39 
 
 
517 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.72 
 
 
534 aa  147  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  31.61 
 
 
509 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.22 
 
 
535 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 
500 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1014  extracellular solute-binding protein family 5  29.37 
 
 
523 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  30.64 
 
 
508 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 
509 aa  140  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  30.25 
 
 
513 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27800  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.91 
 
 
528 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0232  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 
517 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  29.69 
 
 
513 aa  137  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
509 aa  136  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4354  extracellular solute-binding protein family 5  31.94 
 
 
497 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148655  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 
489 aa  133  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  31.61 
 
 
518 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 
490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  28.67 
 
 
497 aa  131  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 
498 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 
546 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  31.59 
 
 
521 aa  130  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  31.19 
 
 
492 aa  130  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  28.46 
 
 
519 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  30.68 
 
 
506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6472  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  32.83 
 
 
495 aa  128  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149439  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  30.64 
 
 
556 aa  128  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  31.03 
 
 
513 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5619  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
526 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  28.21 
 
 
502 aa  126  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.83 
 
 
513 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  27.94 
 
 
502 aa  124  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  29.04 
 
 
513 aa  124  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  27.81 
 
 
551 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7174  peptide ABC transporter substrate-binding protein  26.63 
 
 
503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  30.72 
 
 
532 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.97 
 
 
508 aa  121  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  33.55 
 
 
495 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  30.72 
 
 
532 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  27.65 
 
 
524 aa  120  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7516  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.46 
 
 
565 aa  120  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 
501 aa  120  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 
492 aa  119  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0295  extracellular solute-binding protein family 5  27.24 
 
 
558 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0919  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  30.84 
 
 
539 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.654123  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 
505 aa  118  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  30.65 
 
 
490 aa  118  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 
610 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 
495 aa  117  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  26.61 
 
 
514 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.01 
 
 
492 aa  116  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.01 
 
 
479 aa  116  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0689  extracellular solute-binding protein family 5  29.19 
 
 
544 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.46 
 
 
566 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 
522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.69 
 
 
520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 
530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  27.12 
 
 
532 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1771  extracellular solute-binding protein family 5  28.92 
 
 
547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 
531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4734  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676308  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  26.58 
 
 
542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0216  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.923383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  28.29 
 
 
556 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 
544 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  30.41 
 
 
499 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0112  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 
506 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876976  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 
510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  30.64 
 
 
528 aa  114  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  31.63 
 
 
495 aa  114  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.39 
 
 
510 aa  114  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 
510 aa  114  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2494  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.44 
 
 
532 aa  113  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259695  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.06 
 
 
511 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  26.33 
 
 
537 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2543  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.44 
 
 
532 aa  113  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0657942  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  30.03 
 
 
503 aa  113  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0255  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 
554 aa  113  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192685  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0062  ABC nickel transporter, periplasmic ligand binding protein  26.52 
 
 
511 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.01 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0507  extracellular solute-binding protein family 5  26.33 
 
 
537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 
510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.17 
 
 
509 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  26 
 
 
544 aa  111  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2701  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
534 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1603  extracellular solute-binding protein family 5  28.95 
 
 
539 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.654936  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0658  extracellular solute-binding protein family 5  30.65 
 
 
577 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  29.67 
 
 
510 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  32.31 
 
 
562 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 
528 aa  110  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3267  extracellular solute-binding protein family 5  28.82 
 
 
534 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485271  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  30.75 
 
 
512 aa  110  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>