More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0135 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 531 aa  1103    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3993  extracellular solute-binding protein family 5  89.64 
 
 		 531 aa  1004    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3741  extracellular solute-binding protein  57.14 
 
 		 532 aa  631  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  43.06 
 
 		 546 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  42.64 
 
 		 547 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  41.87 
 
 		 547 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  44.18 
 
 		 529 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  44.18 
 
 		 529 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  43.79 
 
 		 533 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  41.85 
 
 		 564 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  45.1 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  43.14 
 
 		 533 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3829  extracellular solute-binding protein  42.02 
 
 		 569 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  43.37 
 
 		 530 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  43.37 
 
 		 530 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  43.37 
 
 		 530 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1253  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  43.14 
 
 		 533 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  40.3 
 
 		 550 aa  418  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  42.55 
 
 		 533 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  42.94 
 
 		 533 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  42.55 
 
 		 533 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  43.37 
 
 		 530 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  43.37 
 
 		 530 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  42.35 
 
 		 533 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  43.82 
 
 		 535 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  43.17 
 
 		 530 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  40.65 
 
 		 529 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  41.46 
 
 		 529 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  40.61 
 
 		 532 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0799  extracellular solute-binding protein  43.58 
 
 		 531 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162067  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  43.88 
 
 		 529 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  43 
 
 		 530 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  43.88 
 
 		 529 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  43.88 
 
 		 529 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1258  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  43.27 
 
 		 543 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1311  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.81 
 
 		 533 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1274  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.81 
 
 		 533 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2562  periplasmic solute-binding protein  41.81 
 
 		 533 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1050  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.81 
 
 		 533 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.28 
 
 		 563 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0247  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.81 
 
 		 533 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279993  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0518  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.81 
 
 		 533 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.886694  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1392  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.81 
 
 		 533 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00928392  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4056  extracellular solute-binding protein  42.51 
 
 		 489 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  40.45 
 
 		 538 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0197  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.88 
 
 		 535 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.0839796 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  40.19 
 
 		 528 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6301  extracellular solute-binding protein family 5  41.48 
 
 		 535 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  40.2 
 
 		 543 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  39.45 
 
 		 518 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  37.64 
 
 		 537 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  40.16 
 
 		 521 aa  372  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2916  4-phytase  39.29 
 
 		 522 aa  364  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3198  extracellular solute-binding protein  39.48 
 
 		 547 aa  360  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2911  extracellular solute-binding protein  37.07 
 
 		 524 aa  359  6e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  38.98 
 
 		 522 aa  355  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3686  extracellular solute-binding protein  37.73 
 
 		 522 aa  346  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3551  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, periplasmic dipeptide/oligopeptide/nickel-binding protein  37.73 
 
 		 522 aa  346  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  35.24 
 
 		 529 aa  342  7e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1799  extracellular solute-binding protein family 5  36.4 
 
 		 531 aa  341  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0907769  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  34.97 
 
 		 529 aa  335  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1763  extracellular solute-binding protein family 5  38.1 
 
 		 536 aa  332  8e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0553  extracellular solute-binding protein  38.65 
 
 		 522 aa  332  9e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.727867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4044  extracellular solute-binding protein family 5  36.62 
 
 		 536 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  36.62 
 
 		 536 aa  325  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  35.83 
 
 		 538 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3371  extracellular solute-binding protein family 5  35.57 
 
 		 536 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  33.61 
 
 		 538 aa  291  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  35.27 
 
 		 531 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  34.85 
 
 		 531 aa  276  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.98 
 
 		 534 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3537  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 556 aa  264  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1880  extracellular solute-binding protein  32.19 
 
 		 536 aa  263  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5173  extracellular solute-binding protein family 5  31.72 
 
 		 528 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12226  normal  0.127243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 		 536 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3248  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  31.21 
 
 		 540 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5442  extracellular solute-binding protein family 5  31.78 
 
 		 528 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  28.84 
 
 		 523 aa  238  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 		 525 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  29.48 
 
 		 516 aa  176  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  29.25 
 
 		 516 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  29.25 
 
 		 516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  29.25 
 
 		 516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  29.28 
 
 		 516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 		 516 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.88 
 
 		 516 aa  169  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  28.06 
 
 		 566 aa  162  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  28.05 
 
 		 515 aa  160  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1982  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 543 aa  160  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17175 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.46 
 
 		 534 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 516 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  28.63 
 
 		 505 aa  157  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 521 aa  157  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.22 
 
 		 544 aa  157  6e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.27 
 
 		 535 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.34 
 
 		 544 aa  149  9e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0927  extracellular solute-binding protein family 5  27.7 
 
 		 544 aa  148  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.887829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5772  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 534 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228919  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 525 aa  146  9e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.28 
 
 		 516 aa  146  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>