More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1906 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  74.54 
 
 
546 aa  825    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
543 aa  1111    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  70.45 
 
 
547 aa  786    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  71.19 
 
 
547 aa  787    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  65.51 
 
 
550 aa  751    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3829  extracellular solute-binding protein  61.74 
 
 
569 aa  654    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  58.38 
 
 
529 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  54.29 
 
 
564 aa  612  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  57.61 
 
 
538 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  57.61 
 
 
529 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  51.54 
 
 
533 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  51.74 
 
 
533 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  48.34 
 
 
518 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1253  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  50.87 
 
 
533 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  51.67 
 
 
533 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  51.67 
 
 
533 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  51.36 
 
 
535 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  51.47 
 
 
533 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  48.85 
 
 
529 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1274  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  50.29 
 
 
533 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2562  periplasmic solute-binding protein  50.29 
 
 
533 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  48.66 
 
 
529 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  50.88 
 
 
563 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1392  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  50.29 
 
 
533 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00928392  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1311  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  50.29 
 
 
533 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  48.85 
 
 
528 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1050  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  50.29 
 
 
533 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0247  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  50.29 
 
 
533 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279993  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0518  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  50.29 
 
 
533 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.886694  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6301  extracellular solute-binding protein family 5  51.2 
 
 
535 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0197  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  51.59 
 
 
535 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.0839796 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4056  extracellular solute-binding protein  51.6 
 
 
489 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  48.66 
 
 
529 aa  485  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1258  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  47.33 
 
 
543 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  49.31 
 
 
533 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  47.52 
 
 
529 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  47.52 
 
 
529 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  47.52 
 
 
529 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  49.11 
 
 
530 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  49.11 
 
 
530 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  49.11 
 
 
530 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  49.11 
 
 
530 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  48.92 
 
 
530 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  49.11 
 
 
530 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  47.99 
 
 
532 aa  474  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  49.2 
 
 
530 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0799  extracellular solute-binding protein  47.4 
 
 
531 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162067  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  42.8 
 
 
537 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  41.46 
 
 
529 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  39.81 
 
 
531 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3993  extracellular solute-binding protein family 5  39.43 
 
 
531 aa  398  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  40.19 
 
 
529 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3198  extracellular solute-binding protein  43.46 
 
 
547 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271789  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3741  extracellular solute-binding protein  38.19 
 
 
532 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3551  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, periplasmic dipeptide/oligopeptide/nickel-binding protein  37.76 
 
 
522 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3686  extracellular solute-binding protein  37.76 
 
 
522 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  37.83 
 
 
538 aa  350  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2916  4-phytase  38.02 
 
 
522 aa  350  5e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  39.38 
 
 
522 aa  350  5e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  36.85 
 
 
521 aa  346  5e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0553  extracellular solute-binding protein  39.26 
 
 
522 aa  340  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.727867  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  37.84 
 
 
531 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  38.05 
 
 
536 aa  336  7e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  37.08 
 
 
534 aa  336  7.999999999999999e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  35.63 
 
 
538 aa  335  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  37.66 
 
 
531 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2911  extracellular solute-binding protein  36.47 
 
 
524 aa  334  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3537  extracellular solute-binding protein  36.65 
 
 
556 aa  323  5e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3371  extracellular solute-binding protein family 5  36.9 
 
 
536 aa  323  6e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4044  extracellular solute-binding protein family 5  36.16 
 
 
536 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  36.35 
 
 
536 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5442  extracellular solute-binding protein family 5  33.7 
 
 
528 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0169825 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5173  extracellular solute-binding protein family 5  33.52 
 
 
528 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12226  normal  0.127243 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1799  extracellular solute-binding protein family 5  33.59 
 
 
531 aa  297  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0907769  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3248  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  34.23 
 
 
540 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1880  extracellular solute-binding protein  34.33 
 
 
536 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70178  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  35.26 
 
 
525 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1763  extracellular solute-binding protein family 5  32.89 
 
 
536 aa  283  6.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  33.85 
 
 
523 aa  276  5e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  31.82 
 
 
515 aa  216  7e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 
501 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 
501 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.7 
 
 
516 aa  180  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.18 
 
 
534 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  28.7 
 
 
516 aa  178  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  28.7 
 
 
516 aa  178  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  30.59 
 
 
566 aa  177  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.52 
 
 
516 aa  178  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 
516 aa  176  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 
516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.33 
 
 
516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.68 
 
 
535 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.42 
 
 
510 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.15 
 
 
516 aa  170  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  31.05 
 
 
504 aa  167  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  28.69 
 
 
532 aa  166  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
501 aa  163  6e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  30.65 
 
 
504 aa  163  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  27.24 
 
 
544 aa  160  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 
544 aa  160  5e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>