More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0553 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3551  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, periplasmic dipeptide/oligopeptide/nickel-binding protein  83.72 
 
 		 522 aa  903    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0553  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 522 aa  1052    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.727867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  81.24 
 
 		 522 aa  850    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3686  extracellular solute-binding protein  83.72 
 
 		 522 aa  903    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2916  4-phytase  55.62 
 
 		 522 aa  574  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  51.43 
 
 		 521 aa  545  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2911  extracellular solute-binding protein  48.85 
 
 		 524 aa  494  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1799  extracellular solute-binding protein family 5  47.33 
 
 		 531 aa  476  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0907769  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  46.26 
 
 		 529 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1763  extracellular solute-binding protein family 5  46.42 
 
 		 536 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  44.69 
 
 		 529 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  40.32 
 
 		 529 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  39.81 
 
 		 564 aa  388  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  40.37 
 
 		 538 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  40.12 
 
 		 529 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  39.62 
 
 		 546 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  40.07 
 
 		 547 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  38.17 
 
 		 518 aa  365  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  39.33 
 
 		 547 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3829  extracellular solute-binding protein  39.31 
 
 		 569 aa  361  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  39.42 
 
 		 543 aa  360  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3993  extracellular solute-binding protein family 5  39.64 
 
 		 531 aa  356  5e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  37.81 
 
 		 550 aa  356  5e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  38.49 
 
 		 528 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  38.66 
 
 		 531 aa  353  4e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0799  extracellular solute-binding protein  38.82 
 
 		 531 aa  352  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162067  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  40.73 
 
 		 533 aa  352  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  40.86 
 
 		 530 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  40.86 
 
 		 530 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  40.86 
 
 		 530 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  40.86 
 
 		 530 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  40.86 
 
 		 530 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  38.52 
 
 		 537 aa  350  4e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  40.67 
 
 		 530 aa  350  5e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  41.83 
 
 		 533 aa  349  7e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  41.17 
 
 		 533 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  41.17 
 
 		 533 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  41.63 
 
 		 533 aa  347  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3198  extracellular solute-binding protein  39.8 
 
 		 547 aa  345  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1253  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  41.17 
 
 		 533 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  41.1 
 
 		 533 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.39 
 
 		 563 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2562  periplasmic solute-binding protein  41.37 
 
 		 533 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1050  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.37 
 
 		 533 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1274  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.37 
 
 		 533 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834925  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0518  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.37 
 
 		 533 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.886694  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0247  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.37 
 
 		 533 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279993  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  40.44 
 
 		 530 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1392  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.18 
 
 		 533 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00928392  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1311  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.37 
 
 		 533 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  36.15 
 
 		 532 aa  339  7e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  39.69 
 
 		 529 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  39.29 
 
 		 529 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4056  extracellular solute-binding protein  41.7 
 
 		 489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  40.43 
 
 		 535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  39.14 
 
 		 529 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  38.51 
 
 		 529 aa  331  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  38.51 
 
 		 529 aa  331  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  38.51 
 
 		 529 aa  331  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1258  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  38.51 
 
 		 543 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3741  extracellular solute-binding protein  35.55 
 
 		 532 aa  326  7e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0197  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.13 
 
 		 535 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.0839796 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6301  extracellular solute-binding protein family 5  38.14 
 
 		 535 aa  315  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  33.2 
 
 		 531 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  32.81 
 
 		 531 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  32.81 
 
 		 525 aa  250  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3371  extracellular solute-binding protein family 5  31.42 
 
 		 536 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  31.32 
 
 		 523 aa  241  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  31.64 
 
 		 536 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 538 aa  236  7e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 		 538 aa  234  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  30.08 
 
 		 536 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4044  extracellular solute-binding protein family 5  29.89 
 
 		 536 aa  233  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5442  extracellular solute-binding protein family 5  29.96 
 
 		 528 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169825 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5173  extracellular solute-binding protein family 5  29.79 
 
 		 528 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12226  normal  0.127243 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.19 
 
 		 534 aa  225  2e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3537  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 		 556 aa  223  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1880  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 536 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70178  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3248  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  28.87 
 
 		 540 aa  207  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  31.2 
 
 		 515 aa  206  6e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  32.15 
 
 		 516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 		 521 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  30.8 
 
 		 516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  30.8 
 
 		 516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  30.8 
 
 		 516 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  30.8 
 
 		 516 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  30 
 
 		 516 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5772  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 534 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228919  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  30.02 
 
 		 516 aa  166  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  27.97 
 
 		 566 aa  159  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 501 aa  152  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.59 
 
 		 520 aa  150  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1084  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.11 
 
 		 539 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  25.76 
 
 		 535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.15 
 
 		 534 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.51 
 
 		 535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  24.86 
 
 		 544 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  26.49 
 
 		 509 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>