More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1799 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1763  extracellular solute-binding protein family 5  68.86 
 
 
536 aa  735    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1799  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
531 aa  1075    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0907769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2911  extracellular solute-binding protein  55.53 
 
 
524 aa  591  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  46.52 
 
 
522 aa  471  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2916  4-phytase  45.9 
 
 
522 aa  471  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3686  extracellular solute-binding protein  45.61 
 
 
522 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3551  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, periplasmic dipeptide/oligopeptide/nickel-binding protein  45.61 
 
 
522 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  46.32 
 
 
521 aa  464  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0553  extracellular solute-binding protein  47.41 
 
 
522 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.727867  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  38.24 
 
 
529 aa  353  5e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3993  extracellular solute-binding protein family 5  36.67 
 
 
531 aa  347  3e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  36.4 
 
 
531 aa  341  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  36.57 
 
 
532 aa  336  5.999999999999999e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 
564 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  34.97 
 
 
529 aa  330  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3741  extracellular solute-binding protein  34.96 
 
 
532 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0799  extracellular solute-binding protein  36.72 
 
 
531 aa  323  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162067  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  35.6 
 
 
518 aa  320  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3198  extracellular solute-binding protein  37.7 
 
 
547 aa  320  5e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271789  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  34.69 
 
 
529 aa  320  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  36.03 
 
 
529 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  35.8 
 
 
546 aa  316  8e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  35.08 
 
 
537 aa  315  9e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  34.71 
 
 
528 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  36.47 
 
 
533 aa  311  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  35.63 
 
 
529 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  35.44 
 
 
529 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  34.89 
 
 
538 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 
529 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 
529 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 
529 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 
529 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  36.02 
 
 
530 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  36.02 
 
 
530 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  36.02 
 
 
530 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1258  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  34.87 
 
 
543 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  36.02 
 
 
530 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  33.53 
 
 
550 aa  305  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  36.02 
 
 
530 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3829  extracellular solute-binding protein  34.68 
 
 
569 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  35.83 
 
 
530 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  34.12 
 
 
533 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  34.12 
 
 
533 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  33.65 
 
 
547 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  35.73 
 
 
530 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1253  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  34.31 
 
 
533 aa  297  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  33.14 
 
 
547 aa  296  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 
543 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  33.92 
 
 
533 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 
533 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  33.92 
 
 
533 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2562  periplasmic solute-binding protein  34.71 
 
 
533 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.39 
 
 
563 aa  293  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0518  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.71 
 
 
533 aa  293  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.886694  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1274  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.71 
 
 
533 aa  293  6e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834925  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1050  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.71 
 
 
533 aa  293  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1311  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.71 
 
 
533 aa  293  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0247  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.71 
 
 
533 aa  293  6e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279993  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1392  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.51 
 
 
533 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00928392  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  33.27 
 
 
535 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0197  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34 
 
 
535 aa  287  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.0839796 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4056  extracellular solute-binding protein  33.81 
 
 
489 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6301  extracellular solute-binding protein family 5  33.6 
 
 
535 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  31.48 
 
 
531 aa  242  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  31.4 
 
 
531 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 
538 aa  221  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 
538 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  29.02 
 
 
523 aa  212  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 
525 aa  210  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.02 
 
 
534 aa  208  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3371  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 
536 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5442  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 
528 aa  203  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0169825 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  27.76 
 
 
536 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3537  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 
556 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4044  extracellular solute-binding protein family 5  27.36 
 
 
536 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5173  extracellular solute-binding protein family 5  27.34 
 
 
528 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12226  normal  0.127243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 
536 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1880  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 
536 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70178  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3248  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  26.05 
 
 
540 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 
515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
516 aa  160  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  27.03 
 
 
516 aa  154  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  27.03 
 
 
516 aa  154  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.5 
 
 
516 aa  154  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 
516 aa  153  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.5 
 
 
516 aa  153  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.48 
 
 
516 aa  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 
566 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.11 
 
 
516 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 
521 aa  147  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0927  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 
544 aa  146  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.887829  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5772  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 
534 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228919  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 
545 aa  136  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 
501 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 
526 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 
525 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  26.05 
 
 
531 aa  115  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0554  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 
581 aa  113  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1188  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 
499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000019193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>