More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4121 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 521 aa  1064    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  57.48 
 
 		 516 aa  604  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  57.31 
 
 		 516 aa  599  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  57.42 
 
 		 516 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  57.23 
 
 		 516 aa  595  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  57.42 
 
 		 516 aa  596  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  57.23 
 
 		 516 aa  595  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  57.42 
 
 		 516 aa  597  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  57.23 
 
 		 516 aa  592  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  45.12 
 
 		 515 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  33.91 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  32.16 
 
 		 509 aa  236  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  30.75 
 
 		 534 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  32.79 
 
 		 528 aa  224  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  29.94 
 
 		 566 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 		 501 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  30.68 
 
 		 524 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  31.21 
 
 		 535 aa  220  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  30.1 
 
 		 544 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 		 528 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  32.34 
 
 		 531 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  29.87 
 
 		 544 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 521 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  29.55 
 
 		 521 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.55 
 
 		 521 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  29.55 
 
 		 521 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  31.26 
 
 		 518 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 529 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  29.35 
 
 		 521 aa  210  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 		 526 aa  207  4e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 		 545 aa  206  7e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3686  extracellular solute-binding protein  32.18 
 
 		 522 aa  204  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3551  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, periplasmic dipeptide/oligopeptide/nickel-binding protein  32.18 
 
 		 522 aa  204  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  30.09 
 
 		 547 aa  204  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  30.74 
 
 		 547 aa  203  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0518  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.86 
 
 		 533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.886694  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1274  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.86 
 
 		 533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834925  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1392  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.86 
 
 		 533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00928392  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1050  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.86 
 
 		 533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0247  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.86 
 
 		 533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279993  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  30.36 
 
 		 546 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1311  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.86 
 
 		 533 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2562  periplasmic solute-binding protein  33.66 
 
 		 533 aa  200  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.1 
 
 		 563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.19 
 
 		 550 aa  196  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 529 aa  196  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  27.4 
 
 		 526 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 528 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 525 aa  195  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  31 
 
 		 512 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  30.13 
 
 		 523 aa  194  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  32.56 
 
 		 533 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  32.56 
 
 		 533 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  30.24 
 
 		 538 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  31.05 
 
 		 533 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1253  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  32.23 
 
 		 533 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 508 aa  192  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  29.81 
 
 		 504 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  29.31 
 
 		 525 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 		 533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  29.81 
 
 		 504 aa  191  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  32.37 
 
 		 533 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.79 
 
 		 565 aa  189  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4056  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 		 489 aa  189  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.22 
 
 		 503 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 503 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  33.54 
 
 		 530 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  33.54 
 
 		 530 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  33.54 
 
 		 530 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  33.54 
 
 		 530 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  33.54 
 
 		 530 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  33.54 
 
 		 530 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1188  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 499 aa  188  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000019193  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  32.56 
 
 		 533 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  33.54 
 
 		 530 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  29.88 
 
 		 502 aa  188  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 		 529 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  32.54 
 
 		 529 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  31.46 
 
 		 522 aa  187  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6301  extracellular solute-binding protein family 5  31.07 
 
 		 535 aa  186  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  29.45 
 
 		 504 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  32.21 
 
 		 505 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  29.81 
 
 		 523 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 529 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 527 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4211  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 564 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 		 535 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1258  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.76 
 
 		 543 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  28.33 
 
 		 535 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 521 aa  183  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  27.73 
 
 		 532 aa  183  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  28.17 
 
 		 535 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  30.66 
 
 		 523 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.17 
 
 		 535 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 529 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  28.17 
 
 		 535 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 529 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>