More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0504 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6301  extracellular solute-binding protein family 5  72.55 
 
 
535 aa  753    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  100 
 
 
530 aa  1078    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  83.58 
 
 
529 aa  905    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  100 
 
 
530 aa  1078    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1274  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  73.96 
 
 
533 aa  768    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2562  periplasmic solute-binding protein  73.77 
 
 
533 aa  766    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  100 
 
 
530 aa  1078    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1253  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  74.12 
 
 
533 aa  778    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1258  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  83.58 
 
 
543 aa  899    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  73.92 
 
 
533 aa  776    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  100 
 
 
530 aa  1078    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1050  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  73.96 
 
 
533 aa  768    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  94.56 
 
 
533 aa  986    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  73.95 
 
 
563 aa  763    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1392  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  73.77 
 
 
533 aa  766    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00928392  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  84.15 
 
 
529 aa  904    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4056  extracellular solute-binding protein  74.54 
 
 
489 aa  749    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  85.09 
 
 
529 aa  907    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0197  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  73.75 
 
 
535 aa  763    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.0839796 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  73.92 
 
 
533 aa  778    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  84.15 
 
 
529 aa  904    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  70.72 
 
 
535 aa  744    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1311  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  73.77 
 
 
533 aa  764    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  83.4 
 
 
529 aa  902    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  74.9 
 
 
533 aa  788    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  99.62 
 
 
530 aa  1072    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  63.26 
 
 
528 aa  691    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  84.15 
 
 
529 aa  904    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  73.92 
 
 
533 aa  778    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  99.81 
 
 
530 aa  1077    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0247  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  73.96 
 
 
533 aa  768    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279993  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  74.51 
 
 
533 aa  784    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  100 
 
 
530 aa  1078    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0518  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  73.96 
 
 
533 aa  768    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.886694  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  50.1 
 
 
547 aa  528  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  49.33 
 
 
547 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  50.49 
 
 
529 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  50.2 
 
 
546 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  51.08 
 
 
538 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3829  extracellular solute-binding protein  51.07 
 
 
569 aa  505  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  50.1 
 
 
529 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  49.11 
 
 
543 aa  501  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  46.34 
 
 
550 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  48.69 
 
 
518 aa  475  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  45.38 
 
 
532 aa  461  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  44.97 
 
 
564 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0799  extracellular solute-binding protein  45.87 
 
 
531 aa  445  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162067  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3993  extracellular solute-binding protein family 5  43.57 
 
 
531 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  43.33 
 
 
531 aa  437  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  42.21 
 
 
529 aa  430  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3741  extracellular solute-binding protein  40.87 
 
 
532 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  41.94 
 
 
537 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3198  extracellular solute-binding protein  44.99 
 
 
547 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271789  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  40.4 
 
 
529 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  40.38 
 
 
521 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  40.24 
 
 
522 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2916  4-phytase  40.75 
 
 
522 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3551  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, periplasmic dipeptide/oligopeptide/nickel-binding protein  39.46 
 
 
522 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3686  extracellular solute-binding protein  39.46 
 
 
522 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2911  extracellular solute-binding protein  37.83 
 
 
524 aa  363  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0553  extracellular solute-binding protein  40.51 
 
 
522 aa  350  4e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.727867  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1763  extracellular solute-binding protein family 5  37.02 
 
 
536 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1799  extracellular solute-binding protein family 5  36.2 
 
 
531 aa  325  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0907769  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  35.82 
 
 
531 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  35.88 
 
 
531 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3371  extracellular solute-binding protein family 5  35.73 
 
 
536 aa  303  5.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 
536 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  34.13 
 
 
538 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5173  extracellular solute-binding protein family 5  35.47 
 
 
528 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12226  normal  0.127243 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5442  extracellular solute-binding protein family 5  35.8 
 
 
528 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0169825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3248  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  35.32 
 
 
540 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  33.86 
 
 
536 aa  292  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4044  extracellular solute-binding protein family 5  33.66 
 
 
536 aa  289  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1880  extracellular solute-binding protein  36.48 
 
 
536 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70178  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  33.27 
 
 
534 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3537  extracellular solute-binding protein  34.28 
 
 
556 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 
538 aa  280  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  32.37 
 
 
525 aa  247  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  31.47 
 
 
523 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  33.02 
 
 
516 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  33.61 
 
 
521 aa  202  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  28.38 
 
 
515 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  31.23 
 
 
516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 
516 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  31.23 
 
 
516 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  31.23 
 
 
516 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  31.23 
 
 
516 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  31.23 
 
 
516 aa  182  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  30.74 
 
 
516 aa  176  8e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1660  extracellular solute-binding protein family 5  28.49 
 
 
539 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40005  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3666  extracellular solute-binding protein family 5  28.66 
 
 
563 aa  154  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4049  twin-arginine translocation pathway signal  31.28 
 
 
539 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.684503  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0882  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  32.84 
 
 
539 aa  154  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0716  peptide/oligopeptide/nickel ABC transporter substrate-binding protein  26.95 
 
 
541 aa  153  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  31.22 
 
 
531 aa  150  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
525 aa  148  3e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5772  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 
534 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228919  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4660  extracellular solute-binding protein  30.62 
 
 
540 aa  147  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.845725  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.25 
 
 
534 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
501 aa  145  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>