More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4004 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6301  extracellular solute-binding protein family 5  86.54 
 
 		 535 aa  912    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  68.85 
 
 		 529 aa  742    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1392  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  78.54 
 
 		 533 aa  836    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00928392  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  69.23 
 
 		 529 aa  747    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  82.45 
 
 		 533 aa  869    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  70.89 
 
 		 530 aa  750    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1274  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  78.74 
 
 		 533 aa  838    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834925  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  71.14 
 
 		 530 aa  746    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2562  periplasmic solute-binding protein  78.74 
 
 		 533 aa  837    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  70.89 
 
 		 530 aa  750    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  69.04 
 
 		 529 aa  746    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1050  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  78.74 
 
 		 533 aa  838    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1253  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  81.96 
 
 		 533 aa  870    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1258  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  69.23 
 
 		 543 aa  749    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  67.11 
 
 		 528 aa  747    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  71.85 
 
 		 533 aa  757    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  80.04 
 
 		 563 aa  837    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  70.89 
 
 		 530 aa  750    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  81.76 
 
 		 533 aa  868    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0197  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  85.61 
 
 		 535 aa  916    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.0839796 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  70.89 
 
 		 530 aa  750    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  81.96 
 
 		 533 aa  872    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  69.23 
 
 		 529 aa  747    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4056  extracellular solute-binding protein  81.56 
 
 		 489 aa  824    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 535 aa  1100    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  69.23 
 
 		 529 aa  749    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  82.45 
 
 		 533 aa  867    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1311  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  78.54 
 
 		 533 aa  835    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  69.23 
 
 		 529 aa  747    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  81.96 
 
 		 533 aa  872    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  70.69 
 
 		 530 aa  748    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0247  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  78.74 
 
 		 533 aa  838    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279993  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  70.89 
 
 		 530 aa  750    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0518  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  78.74 
 
 		 533 aa  838    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.886694  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  53.17 
 
 		 547 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  53.17 
 
 		 547 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  52.6 
 
 		 546 aa  557  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3829  extracellular solute-binding protein  51.41 
 
 		 569 aa  532  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  52.07 
 
 		 529 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  48.88 
 
 		 550 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  51.45 
 
 		 543 aa  531  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  52.17 
 
 		 538 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  51.08 
 
 		 529 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  49.05 
 
 		 518 aa  504  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  46.14 
 
 		 564 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  45.3 
 
 		 532 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0799  extracellular solute-binding protein  46.27 
 
 		 531 aa  462  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162067  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3993  extracellular solute-binding protein family 5  43.86 
 
 		 531 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  43.48 
 
 		 531 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3741  extracellular solute-binding protein  42.16 
 
 		 532 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  43.2 
 
 		 537 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  40.61 
 
 		 529 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3198  extracellular solute-binding protein  44.71 
 
 		 547 aa  401  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  39.6 
 
 		 529 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2916  4-phytase  40.34 
 
 		 522 aa  382  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  42.01 
 
 		 522 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3686  extracellular solute-binding protein  39.35 
 
 		 522 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3551  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, periplasmic dipeptide/oligopeptide/nickel-binding protein  39.35 
 
 		 522 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  37.88 
 
 		 521 aa  365  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2911  extracellular solute-binding protein  36.17 
 
 		 524 aa  345  8.999999999999999e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0553  extracellular solute-binding protein  40.43 
 
 		 522 aa  342  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.727867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  38.77 
 
 		 536 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 		 538 aa  323  7e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  36.76 
 
 		 531 aa  320  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3248  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  35.97 
 
 		 540 aa  317  4e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3371  extracellular solute-binding protein family 5  36.75 
 
 		 536 aa  316  6e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1799  extracellular solute-binding protein family 5  33.52 
 
 		 531 aa  315  9e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0907769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  36.22 
 
 		 536 aa  312  7.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  37.01 
 
 		 531 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3537  extracellular solute-binding protein  36.19 
 
 		 556 aa  310  5.9999999999999995e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4044  extracellular solute-binding protein family 5  35.77 
 
 		 536 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  36.31 
 
 		 538 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1880  extracellular solute-binding protein  36.47 
 
 		 536 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1763  extracellular solute-binding protein family 5  33.65 
 
 		 536 aa  306  6e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5173  extracellular solute-binding protein family 5  34.67 
 
 		 528 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12226  normal  0.127243 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5442  extracellular solute-binding protein family 5  34.99 
 
 		 528 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169825 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  33.92 
 
 		 534 aa  287  4e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 		 525 aa  259  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  31.91 
 
 		 523 aa  258  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  32.7 
 
 		 516 aa  207  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  30.62 
 
 		 515 aa  205  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 		 521 aa  205  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  30 
 
 		 516 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  30.06 
 
 		 516 aa  177  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 516 aa  177  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  30.23 
 
 		 516 aa  177  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  30 
 
 		 516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  30.04 
 
 		 516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0882  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  30.55 
 
 		 539 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  30.12 
 
 		 516 aa  171  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1660  extracellular solute-binding protein family 5  29.78 
 
 		 539 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40005  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0716  peptide/oligopeptide/nickel ABC transporter substrate-binding protein  28.15 
 
 		 541 aa  163  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4049  twin-arginine translocation pathway signal  31.57 
 
 		 539 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.684503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5772  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 534 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228919  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4660  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 		 540 aa  154  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.845725  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.75 
 
 		 544 aa  152  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 		 532 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  28.63 
 
 		 505 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.35 
 
 		 540 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>