More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4049 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0716  peptide/oligopeptide/nickel ABC transporter substrate-binding protein  82.78 
 
 		 541 aa  965    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4049  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 539 aa  1115    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.684503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4660  extracellular solute-binding protein  77.26 
 
 		 540 aa  882    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.845725  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1660  extracellular solute-binding protein family 5  95.18 
 
 		 539 aa  1078    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40005  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0882  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  54.53 
 
 		 539 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2418  ABC transporter extracellular solute-binding protein  48.27 
 
 		 544 aa  488  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311467  hitchhiker  0.0000215968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2113  putative ABC transporter substrate-binding protein  37.25 
 
 		 539 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  27.38 
 
 		 515 aa  171  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 516 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.48 
 
 		 516 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  27.65 
 
 		 516 aa  157  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 		 516 aa  157  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.45 
 
 		 516 aa  156  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.45 
 
 		 516 aa  156  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5381  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  29.68 
 
 		 524 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121189  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.03 
 
 		 516 aa  154  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  31.13 
 
 		 531 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 564 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  33.51 
 
 		 529 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  33.51 
 
 		 529 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  33.51 
 
 		 529 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  32.26 
 
 		 531 aa  146  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1258  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.93 
 
 		 543 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 501 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 512 aa  144  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  29.64 
 
 		 547 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 		 536 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 501 aa  143  6e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.92 
 
 		 521 aa  143  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.25 
 
 		 521 aa  143  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.25 
 
 		 521 aa  143  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.25 
 
 		 521 aa  143  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 518 aa  143  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 521 aa  143  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  32.8 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 		 525 aa  141  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  30.37 
 
 		 547 aa  140  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0197  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.17 
 
 		 535 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.0839796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  25.84 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6301  extracellular solute-binding protein family 5  32.18 
 
 		 535 aa  139  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.9 
 
 		 563 aa  139  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 546 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  31.64 
 
 		 533 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  31.55 
 
 		 529 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 538 aa  138  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  31.64 
 
 		 533 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  28.26 
 
 		 512 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1880  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 536 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 		 543 aa  137  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 529 aa  137  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  31.64 
 
 		 533 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  31.64 
 
 		 533 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  28.04 
 
 		 512 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7015  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.36 
 
 		 528 aa  136  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0208042  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 		 528 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1253  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  32.18 
 
 		 533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 		 523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  33.45 
 
 		 530 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  33.45 
 
 		 530 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  27.81 
 
 		 512 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  27.81 
 
 		 512 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  33.45 
 
 		 530 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  33.45 
 
 		 530 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  27.81 
 
 		 512 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  33.45 
 
 		 530 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  33.45 
 
 		 530 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4056  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 489 aa  134  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  30.07 
 
 		 536 aa  134  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  33.1 
 
 		 530 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1392  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.73 
 
 		 533 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00928392  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  27.74 
 
 		 538 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1274  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.73 
 
 		 533 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834925  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1050  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.73 
 
 		 533 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0247  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.73 
 
 		 533 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279993  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0518  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.73 
 
 		 533 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.886694  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3248  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  28.47 
 
 		 540 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 		 533 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2562  periplasmic solute-binding protein  29.73 
 
 		 533 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1311  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31 
 
 		 533 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3371  extracellular solute-binding protein family 5  30.48 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.44 
 
 		 512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 		 529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.44 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.44 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  32.01 
 
 		 540 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4044  extracellular solute-binding protein family 5  29.84 
 
 		 536 aa  131  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 527 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.49 
 
 		 512 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.04 
 
 		 550 aa  130  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.22 
 
 		 512 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  26.22 
 
 		 512 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  26.22 
 
 		 512 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  26.22 
 
 		 493 aa  130  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  31.73 
 
 		 540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3308  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  28.27 
 
 		 514 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>