More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0882 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0882  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  100 
 
 		 539 aa  1113    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0716  peptide/oligopeptide/nickel ABC transporter substrate-binding protein  56.47 
 
 		 541 aa  629  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4660  extracellular solute-binding protein  57.25 
 
 		 540 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.845725  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1660  extracellular solute-binding protein family 5  54.16 
 
 		 539 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40005  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4049  twin-arginine translocation pathway signal  54.53 
 
 		 539 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.684503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2418  ABC transporter extracellular solute-binding protein  47.03 
 
 		 544 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311467  hitchhiker  0.0000215968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2113  putative ABC transporter substrate-binding protein  41.26 
 
 		 539 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  32.03 
 
 		 515 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3248  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  29.77 
 
 		 540 aa  178  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 536 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5381  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  30.93 
 
 		 524 aa  176  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121189  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  31.66 
 
 		 528 aa  174  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3537  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 556 aa  170  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3308  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 528 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 		 501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 		 501 aa  164  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 		 533 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 		 533 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 		 533 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  27.84 
 
 		 536 aa  161  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.4 
 
 		 563 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 533 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4044  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 		 536 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1253  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.35 
 
 		 533 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 		 533 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 		 543 aa  156  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 516 aa  156  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4056  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 		 489 aa  156  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  30.55 
 
 		 535 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 529 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 		 538 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.74 
 
 		 516 aa  154  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6301  extracellular solute-binding protein family 5  30.86 
 
 		 535 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1880  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 536 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 564 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 516 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1258  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.38 
 
 		 543 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0197  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.42 
 
 		 535 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.0839796 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 		 529 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.54 
 
 		 516 aa  152  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 		 529 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 		 529 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 		 529 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0518  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.96 
 
 		 533 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.886694  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1392  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.96 
 
 		 533 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00928392  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1274  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.96 
 
 		 533 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2562  periplasmic solute-binding protein  29.96 
 
 		 533 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1050  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.96 
 
 		 533 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0247  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.96 
 
 		 533 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279993  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  28.54 
 
 		 516 aa  151  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 		 516 aa  151  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1311  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.96 
 
 		 533 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.34 
 
 		 516 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.72 
 
 		 516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  28.91 
 
 		 531 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 538 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 		 529 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 527 aa  148  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  30.03 
 
 		 547 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 531 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 529 aa  147  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  30.43 
 
 		 496 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 496 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7015  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.73 
 
 		 528 aa  146  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0208042  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 537 aa  146  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4355  extracellular solute-binding protein family 5  28.3 
 
 		 495 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0355555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3371  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 		 536 aa  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 532 aa  144  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  29.48 
 
 		 547 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 		 540 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  26.61 
 
 		 525 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 529 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  30.13 
 
 		 540 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.5 
 
 		 540 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  34.32 
 
 		 533 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.54 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  29.37 
 
 		 516 aa  141  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  26.95 
 
 		 538 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.99 
 
 		 550 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1188  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 499 aa  141  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000019193  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  27.39 
 
 		 514 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 546 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.89 
 
 		 510 aa  140  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 535 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 518 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  26.79 
 
 		 523 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  35.51 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  35.51 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  35.51 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  35.51 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  35.51 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  35.51 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 501 aa  139  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 510 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.14 
 
 		 534 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  35.1 
 
 		 530 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>