More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1030 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  100 
 
 
534 aa  1106    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  53.15 
 
 
538 aa  605  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  35.67 
 
 
550 aa  336  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  37.57 
 
 
543 aa  334  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  35.37 
 
 
532 aa  330  4e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  36.2 
 
 
546 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  34.73 
 
 
547 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  34.48 
 
 
547 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3371  extracellular solute-binding protein family 5  34.5 
 
 
536 aa  302  9e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  34.91 
 
 
536 aa  301  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  34.68 
 
 
518 aa  301  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4044  extracellular solute-binding protein family 5  35.34 
 
 
536 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 
529 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3829  extracellular solute-binding protein  35.56 
 
 
569 aa  289  7e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  34.68 
 
 
564 aa  289  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  34.49 
 
 
528 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 
529 aa  286  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3537  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 
556 aa  287  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 
538 aa  286  7e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  33.65 
 
 
537 aa  286  9e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0799  extracellular solute-binding protein  38.14 
 
 
531 aa  282  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162067  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  34.23 
 
 
529 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5442  extracellular solute-binding protein family 5  32.02 
 
 
528 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0169825 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  33.26 
 
 
538 aa  277  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3993  extracellular solute-binding protein family 5  32.17 
 
 
531 aa  277  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  32.29 
 
 
529 aa  276  9e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  31.98 
 
 
531 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5173  extracellular solute-binding protein family 5  32.26 
 
 
528 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12226  normal  0.127243 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  35.34 
 
 
533 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  35.34 
 
 
533 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3198  extracellular solute-binding protein  35.33 
 
 
547 aa  273  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271789  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 
533 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  34.74 
 
 
533 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  34.54 
 
 
533 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  34.33 
 
 
533 aa  270  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1253  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  34.74 
 
 
533 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2562  periplasmic solute-binding protein  34.34 
 
 
533 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4056  extracellular solute-binding protein  35.64 
 
 
489 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1050  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.34 
 
 
533 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  33.47 
 
 
530 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  33.47 
 
 
530 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1274  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.34 
 
 
533 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834925  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  33.47 
 
 
530 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0518  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.34 
 
 
533 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.886694  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  33.47 
 
 
530 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  33.47 
 
 
530 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1392  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.34 
 
 
533 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00928392  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0247  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.34 
 
 
533 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279993  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1311  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.34 
 
 
533 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 
529 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  33.27 
 
 
530 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  34.42 
 
 
535 aa  265  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  33.79 
 
 
529 aa  265  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 
536 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 
529 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.35 
 
 
563 aa  263  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3741  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 
532 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  33.74 
 
 
530 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1258  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  32.41 
 
 
543 aa  253  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6301  extracellular solute-binding protein family 5  33.27 
 
 
535 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 
529 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 
529 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 
529 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0197  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.33 
 
 
535 aa  250  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.0839796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1880  extracellular solute-binding protein  31 
 
 
536 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70178  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 
521 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2911  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 
524 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  30.12 
 
 
531 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  30.02 
 
 
531 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  29.67 
 
 
525 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2916  4-phytase  28.81 
 
 
522 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3248  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  26.97 
 
 
540 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 
522 aa  221  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1763  extracellular solute-binding protein family 5  28.17 
 
 
536 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  29.29 
 
 
523 aa  211  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3686  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 
522 aa  210  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3551  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, periplasmic dipeptide/oligopeptide/nickel-binding protein  28.44 
 
 
522 aa  210  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1799  extracellular solute-binding protein family 5  28.02 
 
 
531 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0907769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0553  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 
522 aa  207  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.727867  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  29.21 
 
 
515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
516 aa  180  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 
516 aa  179  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
516 aa  179  8e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  27.31 
 
 
516 aa  179  9e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.2 
 
 
516 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.36 
 
 
516 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.12 
 
 
516 aa  178  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.48 
 
 
516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 
501 aa  170  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 
501 aa  169  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  26.1 
 
 
566 aa  167  4e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.37 
 
 
535 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.76 
 
 
534 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  27.66 
 
 
502 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.75 
 
 
520 aa  159  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
529 aa  157  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  23.99 
 
 
532 aa  157  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.31 
 
 
532 aa  156  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 
501 aa  154  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 
525 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>