More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5173 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5442  extracellular solute-binding protein family 5  95.45 
 
 		 528 aa  1045    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169825 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5173  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 528 aa  1087    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12226  normal  0.127243 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  39.66 
 
 		 536 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3371  extracellular solute-binding protein family 5  39.29 
 
 		 536 aa  382  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4044  extracellular solute-binding protein family 5  39.29 
 
 		 536 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  36.83 
 
 		 538 aa  356  5.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3537  extracellular solute-binding protein  36.73 
 
 		 556 aa  352  7e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  37.19 
 
 		 532 aa  332  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  36.5 
 
 		 531 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  36.12 
 
 		 531 aa  326  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3248  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  34.46 
 
 		 540 aa  323  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  35.75 
 
 		 537 aa  320  6e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  35.05 
 
 		 546 aa  313  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  35.42 
 
 		 536 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1880  extracellular solute-binding protein  36.38 
 
 		 536 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  34.21 
 
 		 529 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  33.64 
 
 		 547 aa  309  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  33.4 
 
 		 547 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3829  extracellular solute-binding protein  34.67 
 
 		 569 aa  302  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  34.61 
 
 		 538 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 		 529 aa  294  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.84 
 
 		 550 aa  292  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  34.12 
 
 		 564 aa  291  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  33.72 
 
 		 543 aa  288  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  35.43 
 
 		 518 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 538 aa  277  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.26 
 
 		 534 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  36.67 
 
 		 533 aa  274  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 529 aa  271  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  36.11 
 
 		 530 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  36.11 
 
 		 530 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  36.11 
 
 		 530 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  36.11 
 
 		 530 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 		 529 aa  270  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  36.11 
 
 		 530 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  36.11 
 
 		 530 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  33.66 
 
 		 528 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  34.17 
 
 		 529 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0799  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 		 531 aa  265  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162067  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  33.53 
 
 		 529 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  33.98 
 
 		 529 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  33.98 
 
 		 529 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  33.98 
 
 		 529 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  32.37 
 
 		 521 aa  263  6e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  33.53 
 
 		 529 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1258  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  33.79 
 
 		 543 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 		 535 aa  262  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  35.73 
 
 		 530 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  31.72 
 
 		 531 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3741  extracellular solute-binding protein  32.73 
 
 		 532 aa  256  9e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3993  extracellular solute-binding protein family 5  32.12 
 
 		 531 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  33.67 
 
 		 533 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2916  4-phytase  30.6 
 
 		 522 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6301  extracellular solute-binding protein family 5  33.2 
 
 		 535 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1253  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  33.6 
 
 		 533 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0197  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.06 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.0839796 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  33.27 
 
 		 533 aa  240  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.67 
 
 		 563 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3198  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 		 547 aa  239  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1050  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.27 
 
 		 533 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1274  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.27 
 
 		 533 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834925  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0247  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.27 
 
 		 533 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279993  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0518  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.27 
 
 		 533 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.886694  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1392  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.27 
 
 		 533 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00928392  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  32.87 
 
 		 533 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  32.87 
 
 		 533 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  32.87 
 
 		 533 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2562  periplasmic solute-binding protein  33.07 
 
 		 533 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1311  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.07 
 
 		 533 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4056  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 489 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3686  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 		 522 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3551  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, periplasmic dipeptide/oligopeptide/nickel-binding protein  28.65 
 
 		 522 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 		 522 aa  216  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0553  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 		 522 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.727867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  28.94 
 
 		 525 aa  200  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1799  extracellular solute-binding protein family 5  27.34 
 
 		 531 aa  196  7e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0907769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2911  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 524 aa  196  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  28.49 
 
 		 523 aa  195  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1763  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 		 536 aa  182  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  28.03 
 
 		 515 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  29.06 
 
 		 516 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.64 
 
 		 541 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  29.22 
 
 		 516 aa  162  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  29.03 
 
 		 516 aa  160  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 516 aa  160  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  29.22 
 
 		 516 aa  160  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  29.22 
 
 		 516 aa  160  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  29.17 
 
 		 516 aa  156  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 516 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  29.66 
 
 		 532 aa  153  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  28.92 
 
 		 505 aa  143  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3666  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 563 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 528 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  26.46 
 
 		 531 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26.01 
 
 		 524 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5772  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 534 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228919  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 528 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  29 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.71 
 
 		 510 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 521 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>