More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3666 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3666  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 563 aa  1160    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5381  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  37.88 
 
 		 524 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121189  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1855  twin-arginine translocation pathway signal  34.41 
 
 		 540 aa  326  7e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686889  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1562  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 		 556 aa  286  9e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.278775  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0403  twin-arginine translocation pathway signal  31.88 
 
 		 559 aa  282  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  30.14 
 
 		 532 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  27.96 
 
 		 515 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  28.04 
 
 		 532 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 527 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  28.49 
 
 		 544 aa  167  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.54 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.33 
 
 		 516 aa  163  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.33 
 
 		 516 aa  163  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  27.05 
 
 		 544 aa  162  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.12 
 
 		 516 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 516 aa  162  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 538 aa  161  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  27.92 
 
 		 516 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 		 516 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 528 aa  158  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 529 aa  157  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 532 aa  157  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.87 
 
 		 516 aa  156  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 531 aa  154  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 		 529 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 516 aa  154  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.53 
 
 		 544 aa  152  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4056  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 489 aa  150  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 510 aa  150  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.6 
 
 		 516 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 		 575 aa  148  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 538 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 521 aa  147  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.77 
 
 		 529 aa  147  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 501 aa  147  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.28 
 
 		 528 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 501 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 536 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  34.02 
 
 		 529 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  25.96 
 
 		 520 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.91 
 
 		 528 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  24.69 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.09 
 
 		 528 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 501 aa  145  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  27.11 
 
 		 531 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  26.14 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 533 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  27.64 
 
 		 556 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  25.93 
 
 		 535 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  25.93 
 
 		 535 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.88 
 
 		 541 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.93 
 
 		 535 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  25.93 
 
 		 535 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.27 
 
 		 512 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  25.93 
 
 		 535 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.93 
 
 		 535 aa  145  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.93 
 
 		 535 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.93 
 
 		 535 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 518 aa  144  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  34.57 
 
 		 533 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 508 aa  144  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 533 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  34.94 
 
 		 529 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.25 
 
 		 535 aa  144  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  34.94 
 
 		 529 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  34.94 
 
 		 529 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 529 aa  144  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  33.68 
 
 		 529 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  26.74 
 
 		 533 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  25.52 
 
 		 535 aa  144  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.91 
 
 		 528 aa  143  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  27.77 
 
 		 530 aa  143  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  27.77 
 
 		 530 aa  143  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  27.77 
 
 		 530 aa  143  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  27.77 
 
 		 530 aa  143  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  27.77 
 
 		 530 aa  143  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  25.73 
 
 		 535 aa  143  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 531 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 		 523 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  27.77 
 
 		 530 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5442  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 528 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169825 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  27.77 
 
 		 530 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.72 
 
 		 528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.53 
 
 		 529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.72 
 
 		 528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5173  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12226  normal  0.127243 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  25.67 
 
 		 566 aa  141  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 540 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  22.7 
 
 		 534 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0882  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.85 
 
 		 539 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 533 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 533 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.93 
 
 		 526 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.93 
 
 		 526 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.93 
 
 		 526 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 533 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>